日期 | 上课时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 9:30-12:00 | 新一代测序技术在疾病研究中的发展进程及研究前景 | 1、测序技术的发展历史 2、多组学测序技术在慢性疾病研究中的最新方法和动态 3、测序技术在疾病研究中的热点分享
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13:30-17:30 | 经典案例分享和方案设计与文章架构设计 | 1、经典文章回顾,未来发展方向 2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 |
第二天 | 9:00-12:00 | 全基因组重测序&全外显子测序 | 1、在慢性疾病分析中的研究思路及应用 2、高通量及芯片测序技术原理 3、数据分析原理、流程 4、Linux常用命令使用和上机操作; |
13:30-17:30 | 1、数据质量控制与数据过滤 2、使用BWA和Samtools进行数据比对及结果可视化 3、寻找SNP和Indel并进行注释 4、基因组变异ANNOVAR功能注释 |
第三天 | 9:00-17:30 | 转录组测序技术 | 1、疾病相关转录组研究策略与分析方法 2、转录组相关测序技术原理与分析流程 3、定量分析、表达量计算、SNP检测、可变剪切分析&基因融合检测等常用信息分析方法 4、非编码RNA在慢性疾病中的功能与研究方法 5、非编码RNA的预测,功能分析,靶基因鉴定 6、项目设计与案例分析 |
第四天 | 9:00-17:30 | 表观遗传学 | 1、表观遗传学在慢性疾病分析中的研究思路 2、研究技术:BS、RRBS、MBD、CHIP-seq 3、常用信息分析方法 |
第五天 | 9:00-17:30 | 蛋白质组学
| 1、蛋白质组学简介 2、蛋白质组定性鉴定 3、蛋白质翻译后修饰鉴定 4、蛋白质组数据处理的质量控制 5、蛋白质组定量 6、蛋白质基因组学 7、蛋白质组方法应用 |