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我这过年都没回家的博士生,除夕都要在科室值班!看完这首都医科大学11.1分的巨噬细胞SCI文章,都被我自己感动哭了……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2025-01-28 08:20

正文

在巨噬细胞相关研究领域,除了巨噬细胞极化备受关注外,巨噬细胞的吞噬作用研究同样充满趣味与价值。夏老师在 PubMed 数据库中冲浪时,发现了一篇由首都医科大学发表于影响因子为11.1分的期刊EBio Medicine 上的文章,该文章聚焦于巨噬细胞的吞噬作用(他们通过假设和假设的迭代,一步步推理得到了最后的结果,假设和假设的迭代,是一篇文章中推理即推进的关键步骤,不清楚的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》),为我们揭开了这一领域的新奥秘。

巨噬细胞的吞噬过程,本质上是吞噬细胞摄取细菌或其他物质的生理活动。在相关研究中,脑出血性卒中(ICH)模型常被用于探索巨噬细胞的吞噬作用。研究表明,增强小胶质细胞 / 巨噬细胞对红细胞的吞噬能力,进而加速血肿消退,是治疗 ICH 的有效策略。衣康酸作为三羧酸循环的重要中间体,此前已知其能够调控巨噬细胞极化,基于此,研究团队大胆假设,衣康酸或许也能对巨噬细胞的吞噬功能产生调控作用。通过提出假设,并对假设进行实验验证,完成了整个课题的研究,并得出结论,这样的过程是科研应该有的样子,假设和假设的迭代,在课题的推进过程中也尤为重要,不清楚假设和假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》为验证这一假设,研究人员提取了小鼠的原代骨髓来源巨噬细胞(BMDM),并使用衣康酸进行处理,随后开展二代测序分析。测序结果显示,经衣康酸处理后,与吞噬作用相关的基因表达显著富集。

同时,研究人员将 pH 敏感乳胶珠与 BMDM 共同孵育,实验结果表明,在衣康酸处理后,巨噬细胞的吞噬作用明显增强。在吞噬作用相关的转录因子研究中,过氧化物酶体增殖物激活受体 γ(PPARγ)和核呼吸因子 2 亚基(NRF2)是被研究最多的两个关键因子。为进一步探究衣康酸调控巨噬细胞吞噬作用的具体机制,研究人员使用抑制剂进行深入分析这里的研究思路实际上遵循了柯霍氏法则,也就是移除关键因子,然后分析表型的变化,从而获得关键因子与表型之间的关联性,若对柯霍氏法则不太了解,推荐阅读《轻松的文献导读》和《列文虎克读文献》,其中有关于该法则的详细介绍。。结果显示,PPARγ 抑制剂对衣康酸引发的巨噬细胞吞噬作用无明显影响,而 NRF2 抑制剂则能够显著抑制这一过程。这一结果表明,衣康酸可能是通过激活 NRF2,从而增强巨噬细胞的吞噬作用。

提到 NRF2,想必大家并不陌生,它在铁死亡研究中频繁出现。(如果不记得铁死亡的调控过程中, NRF2 与 Keap1 以及 p62 之间的关系,可以看下《信号通路是什么鬼?》系列中关于铁死亡调控的几个章节。)在细胞内,与 NRF2 共同调控转录过程的重要蛋白是 Keap1。

研究人员进一步发现,衣康酸处理并未改变 Keap1 或 NRF2 的 mRNA 水平,却显著影响了 NRF2 的核异位现象,即增强了 NRF2 的转录激活能力,进而促进了 CD36 的转录过程。为明确衣康酸对 Keap1 与 NRF2 结合以及 NRF2 核异位之间的关系,研究人员对 Keap1 上与 NRF2 结合的两个关键氨基酸残基 —— 半胱氨酸 151 和 288 进行了突变处理此处的氨基酸残基突变实验巧妙地揭示了衣康酸对 Keap1→NRF2 功能的影响机制。由于该实验的验证节点精准聚焦于两者之间的结合关系,避免了其他额外因素的干扰,有效规避了肯定后件的逻辑谬误。若对这一逻辑问题感兴趣,可阅读《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《信号通路是什么鬼?》系列。。实验结果显示,当 Keap1 的 151 残基半胱氨酸发生突变后,CD36 的表达水平急剧下降。

基于上述研究结果,研究团队构建了衣康酸增强巨噬细胞吞噬作用的示意图(这样的示意图的话,其实在PPT上,就可以实现,不清楚的话,可以去看看《轻松的文献导读》,里面就有介绍如何绘制这样的示意图):

在衣康酸的作用下,Keap1 的 151 位点发生修饰,导致 Keap1 无法与 NRF2 正常结合,进而使得 NRF2 得以顺利入核,激活 CD36 的转录过程,最终提升了巨噬细胞的吞噬功能。


活化的浸润巨噬细胞是吞噬红细胞的关键吞噬细胞之一,在促进 ICH 后的血肿清除和脑修复过程中发挥着重要作用。此前研究发现,血红素能够诱导巨噬细胞吞噬作用增强。通过二代测序分析,研究人员发现血红素能够轻微上调 Irg1 的表达水平。(Irg1 是线粒体中催化顺乌头酸脱羧生成衣康酸的关键酶。)这一发现表明,Irg1 / 衣康酸轴可能参与了血红素诱导的巨噬细胞吞噬作用。

此外,虽然血红素可能还存在非衣康酸依赖的途径来诱导巨噬细胞吞噬,但实验表明,在血红素孵育过程中增加衣康酸,能够显著提高巨噬细胞的吞噬能力。

为进一步验证 Irg1 / 衣康酸轴在体内的作用,研究人员开展了体内实验。结果显示,Irg1 / 衣康酸轴能够有效促进血肿清除,并显著改善体内 ICH 后的急性症状。

另一方面,巨噬细胞的吞噬作用在抵御病原体入侵方面同样至关重要。为此,研究人员开展了金黄色葡萄球菌感染小鼠的体内实验,探究 Irg1 / 衣康酸轴对巨噬细胞吞噬金黄色葡萄球菌能力的影响。实验结果表明,Irg1 / 衣康酸轴能够显著增强巨噬细胞对金黄色葡萄球菌的吞噬作用,有效改善体内急性腹膜炎后的预后情况。

综上所述,这篇文章在机制研究方面成果显著。研究团队从PPARγ和 NRF2中精准筛选出NRF2作为关键调控因子,并通过Keap1的突变实验,成功揭示了衣康酸对 Keap1→NRF2的具体作用位点。在应用研究方面,文章明确提出了衣康酸在巨噬细胞吞噬功能中,对于清除血肿和清除细菌感染的重要临床意义。在这几个关键研究点上,文章的研究工作扎实且深入,值得我们深入学习与探讨。大家对此有何看法?欢迎在评论区与夏老师互动交流。好了,今天的分享就先到这里,若对原文感兴趣,不妨查阅阅读,希望大家都能在科研探索中保持敏锐的洞察力,心明眼亮。

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