不会预测靶基因的小白--送给你microRNA预测的干货

1 ．进入主页，网址 http://www.microrna.org/

microrna/home.do 。点击 miRNA ，可以预测相应靶基因。点击 Target mRNA, 可以输入基因名称预测可能结合 microRNA 。比如输入 microRNA 名称 has-mir-21 , 选择物种， homo sapiens 。

2. 进入可看到如下界面，选择 view targets ，查看靶基因列表。

3. 以下便是 has-mir-21 可能作用的靶基因。

4 ．点击第一个基因 CLCA3P 后 alignment details ，可以查看 has-mir-21 与 CLCA3P 的结合位点。

5. 不仅如此，网站还列出了与 CLCA3P 基因不同位置可能结合的其他 microRNA 。

1. 进入主页，网址： http://www.mirdb.org/ 。网站既可以预测 microRNA 靶基因，也可以通过基因预测可能结合的 microRNA 。比如输入 microRNA 名称， has-mir-21, 选择物种， human 。

2. 选择 has-mir-21-3P targets 。 mirna 前体会产生两条互补的有功能的成熟 mirna, 他们分别靶向不同的位点，即 5p 与 3p 的种子序列是不同的。

3. 以下便是 has-mir-21 可能作用的靶基因 , 共 485 个。遗憾的是，网站不提供预测基因下载，只能手动复制到 excel 表格。

1. 进入主页， 网址： http://www.targetscan.

org/ vert_71/ 选择查询物种，输入 mir-21 名称。

2. 进入查询结果页面，可以看到预测的靶基因列表。同时，可以查询到 miRNA 与靶基因可能结合位点。

3. 点击 Download table, 下载靶基因预测列表。

1. 网址：

http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

2. 在列表中，输入基因名称（建议输入基因全称）。然后维恩图自动绘制完成，点击交集中数字，可以在 Result 中，查看集合中详细的基因名称。

最后呢，是视频版教程。希望对大家有所帮助。