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图解JanusGraph内部数据存储结构

狗厂  · 掘金  ·  · 2018-05-11 02:45

正文

前面的几篇文章中已经介绍了不少图数据库的基础知识:

从扩线查询能力分析图数据库Titan的设计改进点

一起学图数据库系列:图数据库概述

一起学图数据库系列:图数据库与传统数据库的对比分析

开源图数据库Titan项目已经停止更新,JanusGraph可以说复活了Titan项目,到目前为止,JanusGraph与Titan在核心机制上相差不大。JanusGraph/Titan有如下关键设计:

1. 支持 大规模图数据存储 ,Titan图数据库是建立在分布式集群上,数据存储容量和集群节点数量成正比

2. 支持 弹性和线性扩展 高可用 高容错

3. 支持 Gremlin 图查询语言

4. 支持利用 Hadoop计算框架 对图数据进行分析

5. 支持外部 索引 :ElasticSearch、Solr、Lucene

6. 支持 多储存引擎 :Cassandra、HBase、Berkeley DB和InMemory模式;

7. 基于Apache License 2.0

本文内容以HBase作为Storage Backend,详细介绍JanusGraph的内部数据存储结构。

JanusGraph基本概念

在介绍关系数据的数据存储结构之前,我们先来看一下JanusGraph的基本概念。

同大多数图数据库一样,JanusGraph采用 属性图 进行建模。基于属性图的模型,JanusGraph有如下基本概念:

Vertex Label :节点的类型,用于表示现实世界中的实体类型,比如"人”,“车”。在JanusGraph中,每一个节点有且只有一个Vertex Label。当不显式指定Vertex Label时,采用默认的Vertex Label。

Vertex :节点/顶点,用于表示现实世界中的实体对象。

Edge Label :边的类型,用于表示现实世界中的关系类型,比如“通话关系”,“转账关系”,“微博关注关系”等;

Edge : 边,用于表示一个个具体的联系。JanusGraph的边都是单向边。如果需要双向边,则通过两条相反方向的单向边组成。JanusGraph不存在无向边。

Property Key :属性的类型,比如“姓名”,“年龄”,“时间”等。Property Key有Cardinality的概念。Cardinality有SINGLE、LIST和SET三种选项。这三种选项分别用于表示一个Property中,对于同一个Property Key是只允许有一个值、允许多个可重复的值,还是多个不可重复的值。

Property :属性,用于表示一个个具体的附加信息,采用Key-Value结构。Key就是Property Key,Value就是具体的值。

属性图举例

张三与李四是同事关系,他们从2017年开始成为同事,用属性图表达:

图切割

作为一种分布式图数据库,JanusGraph需要将数据切分存储到多台机器上。

典型的图切割方法有两种: 一种是 按点切割 ,另一种是 按边切割

按点切割(Vertex-Cut)

按Vertex切割时,切割线通过图的Vertex,而不是Edge。每一条Edge边只保存一次,并且每一条Edge只出现在一台机器上,邻居多的Vertex会被分发到不同的机器上。

按边切割(Edge-Cut)

按Edge切割时,切割线只穿过连接vertex的edge,此时,每一个vertex只保存一次。切断的Edge会保存到多台机器上。

JanusGraph采用的分片方式是按Edge切割,而且是对于每一条边,都会被切断。切断后,该边会在起始Vertex上和目的Vertex上各存储一次。通过这种方式,JanusGraph不管是通过起始Vertex,还是从目的Vertex,都能快速找到对端Vertex。

备注

1. 对于Super Node的存储模式不同,这里暂不展开讨论。

2. JanusGraph允许将Edge Label定义为单向感知的edge. 对于单向感知的edge,只会从起始vertex查询此edge,不会从目的vertex反向查询。因此,这种情况下,目的节点不存储该vertex,仅在起始节点存储。

存储方式

还是以上面的例子为例,按边切割后,变成如下结果:

在JanusGraph中,是点为中心,按切边的方式存储数据的。节点的ID作为HBase的Rowkey,节点上的每一个属性和每一条边,作为该Rowkey的一个个独立的Cell。即每一个属性、每一条边,都是一个个独立的 KCV结构(Key-Column-Value)

如下图所示:

备注

简化起见,此处暂不考虑节点中如何记录其所属的Vertex Label。

详细存储格式

Vertex存储格式

1. Vertex ID以Rowkey的形式存储在HBase中,Vertex ID共包含64个bit。

2. Vertex ID由partition id、count、ID padding三部分组成。

3. 最高位5个bit是partition id. partition是JanusGraph抽象出的一个概念。当Storage Backend是HBase时,JanusGraph会根据partition数量,自动计算并配置各个HBase Region的split key,从而将各个partition均匀映射到HBase的多个Region中。然后通过均匀分配partition id最终实现数据均匀打散到Storage Backend的多台机器中。







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