高分文章其实有很多都存在有逻辑问题，因为有的文章工作量大，体量大，得到的结果虽然多，但串不到一块（
一篇文章最重要的，其实就是逻辑性，前后的结果需要通过逻辑作为串联，通过假设和假设迭代，推进课题，否则证据链的不完整，就会导致整篇文章的结构松散，不清楚科研逻辑的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）。今天讲的这篇文章，就是北京大学第三医院的博士生，发表在27.7分的Mol Cancer上的文章。这篇文章讲的是一种巨噬细胞，MDSC（髓系抑制细胞）在索拉非尼作用下的影响。Result有很多，但看上去都像是单元剧，我们就来看看他们都做了些什么吧：
他们首先分析了索拉非尼对于肿瘤的抑制作用，而索拉非尼的耐药可能是他们重点关注的方向。而肿瘤晚期可能产生索拉非尼的耐药，这可能是由于索拉非尼诱导了肿瘤中MDSCs的浸润导致的。于是他们分析了巨噬细胞在索拉非尼用药后的基因表达情况，结果发现巨噬细胞中CCR2表达增多，这也就是驱使着MDSCs浸润的原因。他们通过使用αCCR2（
CCR2的抗体，通过这种方法抑制CCR2的影响，从而分析是否是由于索拉非尼通过对CCR2的诱导造成的MDSCs的浸润，这就是柯霍氏法则的验证，不清楚柯霍氏法则的话，可以去看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》
），结果发现使用αCCR2后，有效抑制了索拉非尼用药后的肿瘤进展。而同时索拉非尼用药后，也会增强MDSCs的免疫抑制功能：
而通过单细胞测序后（
下图的tSNE图，这个就是通过单细胞测序后，将基因的表达作为多维的主成因分析，再进行降维所得到的结果，和UMAP图原理是差不多的，不清楚的话，可以去看看《列文虎克读文献》和《夏老师带你读文献》
），他们发现在索拉非尼用药后MDSC细胞表达的PPARα增多。高表达PPARα的细胞中，也同样存在有MDSCs中免疫抑制相关基因的表达。PPARα与FAO（脂肪酸氧化密切相关），而使用了PPARα抑制剂，或者使用FAO抑制剂，都能降低索拉非尼用药后，导致的MDSCs的浸润增多，同时增强了MDSCs的抑制功能：
那么PPARα是通过什么造成这样的影响的呢？他们通过二代测序，分析了可能有PPARα表达所影响的转录因子，结果发现PPARα可能会促进类似SOX4这样的转录因子的表达，而抑制Spi1（PU.1）这样的转录因子表达：
他们发现敲除了PPARα后，PU.1（Spi1）的表达明显增多，而PU.1是可以促进CSF1R转录的。也就是说，索拉非尼通过PPARα抑制MDSCs中PU.1(Spi1)诱导的CSF1R表达，从而抑制MDSCs向巨细胞分化（
实际上这里无论是使用了Spi1的抑制剂，还是敲减Spi1，都不能解释PPARα对于Spi1实际的具体影响，也就是说，这样就会造成很大的逻辑漏洞，也就是由于两个概念的外延不同，造成了肯定后件的逻辑谬误，虽然看上去使用这样的验证很合理，但实际上完全不能说明任何问题，不清楚肯定后件逻辑谬误的话，可以看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）：
而由于PPARα对于FAO的影响，他们也尝试了使用高脂饮食，来分析是否会影响索拉非尼的抗肿瘤作用。结果显示高脂饮食的确促进了HCC（肝细胞癌）中MDSCs的浸润，并减弱了索拉非尼的抗肿瘤作用（
这里的验证还是同样的毛病，由于不能解释FAO是通过PPARα造成的，所以在这里的验证，无法说明对于索拉非尼的耐药性源于PPARα对于FAO的影响，逻辑思路如果不严谨的话，就会出现这样的问题，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》
）：
最后他们通过抑制PPARα联合索拉非尼用药，结果发现这样可以有效抑制索拉非尼对于MDSCs的作用，增强索拉非尼的抗肿瘤作用：
由于这篇文章整体的结果，其实并不能通过一条完整清晰的逻辑链来进行解释，所以夏老师只能随便画了个示意图。索拉非尼对于PPARα表达促进作用具体机制未知，而高脂饮食造成的FAO增加对于MDSCs的影响也未知，索拉非尼为什么能抑制PU.1（Spi1）-CSF1R，也不清楚，PPARα和FAO对于下游的具体影响也不知道：
缺乏一条完整的主线和证据链，就导致了这篇文章结构的松散，虽然工作量不算小，但机制上基本上就没有啥可以拿的出确凿证据的地方（
科研的过程中，如果缺乏了逻辑，就会造成这样的情况，也就是整体结构的松散，不能形成一条完整的证据链，不清楚科研逻辑的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）。好了，今天就先策到这里吧，有兴趣的话可以看看原文，祝你们心明眼亮。
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