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Mol Cell | SUMO4通过抑制过度SUMO化来促进DNA双链断裂修复

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-03-18 17:14

正文

撰文 | Qi


DNA双链断裂 (DSB) 是细胞中最严重的基因组损伤之一,若不能及时修复,可能导致细胞死亡或癌变。为了应对这种威胁,细胞进化出了一套复杂的修复机制,其中SUMO化 (SUMOylation) 和去SUMO化 (deSUMOylation) 在调控DNA修复过程中扮演了关键角色。SUMO (Small Ubiquitin-like Modifier) 是一类小分子修饰蛋白,类似于泛素 (Ubiquitin) ,能够通过共价结合到靶蛋白上,调控其功能、定位和稳定性。目前已知SUMO家族有四个成员,其中,SUMO1-3的功能已被广泛研究,而SUMO4由于其低表达水平和难以检测的特性而未被充分探索。SUMO4与其他成员虽具有高度同源性,但其C端含有的一个独特的脯氨酸残基被认为可能抑制其修饰能力,近年来的研究表明SUMO4可能在细胞应激反应和DNA修复中发挥重要作用。


2025年3月6日,来自英国伯明翰大学的 Joanna R. Morris 团队在 Molecular Cell 杂志上发表了文章 SUMO4 promotes SUMO deconjugation required for DNA double-strand-break repair ,发现在DNA损伤反应中, SUMO4能阻止BRCA1-A复合物的关键组分RAP80过度募集到损伤位点,从而促进DNA修复,不仅强调了SUMO4在DNA修复中的关键作用,还为SUMO信号传导的调控机制提供了新的见解。



为了研究SUMO4在DNA修复中的作用,该团队首先通过siRNA技术分别敲低SUMO1、SUMO2/3和SUMO4,发现SUMO4的缺失显著影响了DNA在同源重组 (HR) 和非同源末端连接 (NHEJ) 修复途径中的修复效率。与SUMO1和SUMO2/3不同,SUMO4的缺失并未影响MDC1 (一种关键的DNA修复蛋白) 的动力学,但导致RNF168、53BP1和RAD51等修复蛋白在损伤位点的积累减少。SUMO4是否通过SUMO化修饰靶蛋白来发挥上述功能呢?为证明这一点,他们构建了一系列SUMO4突变体并表达于SUMO4缺失细胞系中,发现失去修饰功能的SUMO4突变体能恢复SUMO4缺失细胞的DNA修复能力,这一结果说明SUMO4的功能与其修饰能力无关,而是借助于其非共价相互作用。


有趣的是,该团队发现SUMO4缺失的细胞会表现出SUMO1和SUMO2/3修饰水平的显著增加,而SUMO4的重新表达能够逆转这一现象,因而推测并在体外实验中证实SUMO4是通过与SUMO蛋白酶SENP1 (介导去SUMO化) 相互作用,促进其催化活性来调控细胞内的SUMO化水平。


已知 BRCA1-A复合物的关键组分RAP80包含能够与SUMO2/3和K63-ubiquitin链相互作用的串联SIM-ubiquitin motif 【1-3】 。为了确定RAP80是否受到SUMO4缺失的影响,他们在SUMO1-4 siRNA处理的细胞中评估了RAP80在DNA损伤位点的积累情况。结果显示,SUMO1或SUMO2/3的缺失降低了RAP80灶点强度,相反,SUMO4-siRNA或SENP1-siRNA的单独处理均会引起RAP80的过度积累,但可通过SUMO4的过表达来逆转此情形。与RAP80 WT不同,SIM突变体在SUMO4缺失细胞中并没有增加积累,说明RAP80灶点形成增加需要活跃的SUMO-SIM相互作用。



综上,这项研究 揭示了SUMO4在DNA双链断裂修复中的关键作用 ,简而言之,SUMO4通过增强SUMO蛋白酶SENP1的活性,调控细胞内的SUMO化水平,防止过度的SUMO化信号传导。在DNA损伤反应中,SUMO4通过限制RAP80在损伤位点的过度积累,确保DNA修复的顺利进行。这一发现不仅深化了人们对SUMO信号传导机制的理解,还为癌症治疗提供了新的潜在靶点。


原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.molcel.2025.02.004


制版人: 十一



参考文献


1. Hu, X., Paul, A., and Wang, B. (2012). Rap80 protein recruitment to DNA double-strand breaks requires binding to both small ubiquitin-like modifier (SUMO) and ubiquitin conjugates. J. Biol. Chem . 287, 25510–25519. https://doi.org/10.1074/jbc.M112.374116.

2. Guzzo, C.M., Berndsen, C.E., Zhu, J.M., Gupta, V., Datta, A., Greenberg, R.A., Wolberger, C., and Matunis, M.J. (2012). DNA DAMAGE RNF4- Dependent Hybrid SUMO-Ubiquitin Chains Are Signals for RAP80 and Thereby Mediate the Recruitment of BRCA1 to Sites of DNA Damage. Sci. Signal. 5, ra88. https://doi.org/10.1126/scisignal.2003485.

3. Anamika, and Spyracopoulos, L. (2016). Molecular Basis for Phosphorylation-dependent SUMO Recognition by the DNA Repair Protein RAP80. J. Biol. Chem . 291, 4417–4428. https://doi.org/10.1074/ jbc.M115.705061.


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