Cell | 根际"隐形军团"的神秘面纱被揭开！北京大学白洋团队构建首个作物根际"细菌+病毒"基因组数据库

北京时间2025年3月12日，北京大学 白洋 团队在 Cell 发表了题为 Crop root bacterial and viral genomes reveal unexplored species and microbiome patterns 的研究成果，构建了 首个作物根际细菌基因组数据库 （CRBC） 与 病毒基因组数据库 （CRVC） ，一举突破 植物-菌群互作研究的"数据荒漠"困境 。 该研究不仅将公开的作物根际细菌基因组数量扩展近3倍，更发现1500多个未被报道的根际病毒新属，堪称打开微生物暗物质宝库的“金钥匙”！

破纪录！全球最大根际微生物"基因身份证"库

研究团队历时9年攻坚，通过 可培养细菌+宏基因组拼接 双引擎 驱动，成功建立包含 4618株分离菌株 与 2081个拼接基因组 的CRBC数据库，涵盖2318个物种，将公共数据库的作物根际细菌系统发育多样性提升290.6% （图1） 。这意味着科学家首次手握覆盖主要作物根际的微生物" 全息地图 "，传统微生物组研究中"只见群落，不识真身"的困境将就此终结。

图1 CRBC和公共数据库中代表性物种的系统发育树

颠覆认知！根际微生物的"共性基因语言"

当研究团队将目光投向宏基因组数据时，一个颠覆性规律浮出水面：尽管不同土壤，不同作物的根际菌群组成千差万别，但 根际宏基因组中的细菌双组份信号转导系统，鞭毛运动等核心功能基因却高度保守 （图2） 。这揭示了一个深层进化逻辑——在进化过程中，根际微生物与植物双向选择，形成跨物种的"功能共生同盟"。