▎药明康德内容团队编辑
人工智能（AI）的快速进步正在以前所未有的方式深刻变革生物医药领域。一些生成式AI模型已经能够设计出自然界中前所未有的蛋白质，展现出令人惊叹的创新潜力。然而，在小分子药物设计方面，AI面临更为复杂的挑战——不仅需要全面权衡分子的多样性，还必须深刻理解药物化学以及分子与靶点之间的复杂相互作用。尽管面临诸多技术难题，一些初创公司仍在大胆探索AI在小分子药物设计中的无限可能。近期，知名行业媒体STAT精选出5家引领这一领域的创新企业，备受行业关注。在今天的文章中，药明康德内容团队将结合公开信息，为您带来这些公司的详细介绍。Terray Therapeutics是一家融合了人工智能、生物学、药物化学、自动化和纳米技术，以推动药物发现进入信息时代的生物技术公司。Terray专有的集成计算和实验平台可生成大规模化学数据来加速药物发现。2022年2月，Terray成功获得了6000万美元的A轮融资，以推进其新型tNova平台和基于此的小分子药物发现。今年10月，该公司再次完成1.2亿美元的B轮融资。所筹得资金将推动其基于生成式AI开发的内部管线进入临床试验阶段，并进一步提升Terray的集成AI平台tNova，用以支持内部和合作研发项目。Terray致力于通过大规模整合计算和新型数据，加快小分子药物开发的速度、降低成本并提高成功率，从而改善人类健康。该公司拥有多个人工智能模型，既能预测特定分子的特性，又能通过生成式模型推荐符合多个参数的分子。依托其专有实验平台，Terray构建了全球最大的化学数据集之一，在过去3年中，它已定量测量了超过50亿次靶标-配体相互作用，该数据集每年翻倍增长。Terray的数据优势赋予其潜在“best-in-class”的AI能力，可识别并优化解决复杂问题的新型小分子。该公司与百时美施贵宝（Bristol Myers Squibb）和Calico建立了多靶点合作关系，还与Odyssey Therapeutics建立了合作关系，共同开发针对转录因子靶点的药物。其内部产品线包括一种多发性硬化治疗药物，预计将于2026年进入临床，其他候选药物也将很快推出。Iambic Therapeutics是一家致力于利用AI药物发现平台开发新疗法的公司。公司平台通过结合物理学和AI技术，能够识别出具有差异化药物特征的候选药物。目前，公司的主要候选药物IAM1363已进入临床阶段，这是一种高选择性和脑渗透性的HER2抑制剂。此外，还有一款选择性CDK2/4抑制剂IAM-C1即将进入临床开发阶段。Iambic拥有两个核心人工智能模型：一个模型是NeuralPLexer，它能预测蛋白质和药物分子如何相互作用，并能更好地处理不同状态的蛋白质；另一个模型是Enchant，它能够整合分子物理特性数据和临床数据，从而更准确地预测哪些药物特性会影响临床结果。在融资方面，Iambic在2021年完成了5300万美元的A轮融资，并在2023年完成了1亿美元的B轮超额融资。2024年6月，公司又完成了5000万美元的B轮扩展融资。今年年初，Iambic将HER2抑制剂IAM1363推进至临床阶段。公司预计在2025年上半年讨论IAM1363的1期临床初步数据，并预计很快将另外两个肿瘤项目也推进至临床阶段。Genesis Therapeutics是一家专注于人工智能的生物技术公司，利用其创新的生成式预测人工智能平台GEMS进行小分子药物的发现。GEMS平台融合了深度学习预测模型、分子模拟和化学感知语言模型，通过生成潜在分子进行合成和实验测试，以及AI赋能的多个循环过程迭代，来加速候选分子的选择和优化。Genesis已针对那些数据稀缺且传统上被认为“不可成药”的靶点，建立了包含多个项目的内部研发管线。
在战略合作方面，Genesis今年9月与吉利德科学（Gilead Sciences）达成了战略合作协议，共同发现和开发针对三个未公开靶点的新型小分子疗法。根据协议，吉利德向Genesis支付了3500万美元的预付款。此前，在2022年，Genesis与礼来公司（Eli Lilly and Company）建立了战略合作关系，为一系列治疗领域的五个靶点开发新型疗法，Genesis因此获得了2000万美元的预付款。此外，2020年，Genesis还与基因泰克（Genentech）签署了一项多靶点合作协议。在Genesis的内部产品线中，公司已经开发了针对免疫学和晚期肿瘤的先导候选药物。关于这些候选药物何时能够进入临床试验阶段的具体时间表尚未披露。Isomorphic Labs作为Alphabet的子公司，其使命是利用人工智能技术加速药物发现进程，并最终找到治疗人类最具破坏性疾病的方法，推动医学突破的新时代。在接受STAT采访时，该公司总裁Colin Murdoch先生提到，公司的技术栈包括覆盖药物发现项目整个生命周期的预测模型，以及能够针对特定靶点生成分子的生成式模型。虽然目前公司专注于小分子药物的开发，但发现新型靶点也是公司未来路线图的一部分。Isomorphic拥有一个内部药物管线（治疗领域尚未对外披露），公司计划在药物开发的后期阶段将候选药物对外合作。此外，公司已经宣布了与礼来和诺华（Novartis）的两项合作。每项合作的潜在金额均超过10亿美元，包括里程碑付款和特许权使用费。Atomwise是一家致力于利用AI和机器学习（ML）技术彻底改变小分子药物发现领域的科技生物（TechBio）公司。Atomwise团队将深度学习应用于基于结构的药物设计，以显著缩短药物的开发周期。在合作伙伴关系方面，Atomwise已经与多家知名公司达成了合作协议。公司曾与拜耳（Bayer）就两个农作物保护项目签订了协议，并与礼来和Bridge Biotherapeutics等公司开展了多靶点合作。2020年4月，Atomwise扩展了与豪森药业的战略合作伙伴关系，共同开发创新肿瘤学药物。2022年，Atomwise进一步与赛诺菲（Sanofi）达成了策略性与独家研究合作协议，获得了2000万美元的预付款，并有望获得高达10亿美元的里程碑款项。在产品管线方面，Atomwise正在推进其专有的小分子候选药物管线。公司的主要候选药物之一是一种TYK2抑制剂，这是通过其专有的AI平台AtomNet发现的。据公司介绍，AtomNet是一种先进的神经网络技术，专为预测基于结构的药物发现中小分子的生物活性而设计，其能力甚至有可能取代传统的高通量筛选方法。随着人工智能技术在生物医药领域的应用不断深化，其在新药发现和开发过程中所展现的潜力正日益显著。展望未来，我们期待这些先锋企业继续推动全球健康领域的创新变革，并为增进人类健康福祉做出持续贡献。▲欲了解更多前沿技术在生物医药产业中的应用，请长按扫描上方二维码，即可访问“药明直播间”，观看相关话题的直播讨论与精彩回放
参考资料：
[1]Using AI to design small
molecule drugs is tough. Here are five companies trying to crack the code，Retrieved December 6, 2024 from https://www.statnews.com/2024/12/03/who-to-know-series-biotech-companies-using-ai-small-molecules/
[2] 各公司网站
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