科研工作者在做靶向代谢组学时,经常发现关注的某一个物质或某一类物质在市场上没有成熟的检测方法。针对此类问题,我司推出了定制靶向开发技术服务。定制靶向开发是针对客户关注的某一个物质或某一类物质,结合物质的物理、化学等性质,开发一套专属的检测方法,实现对目标代谢物的精准定量。定制靶向开发将标准品作为参考,根据要检测物质的类别,选择特异性的样本前处理方法,优化LC-MS/MS的检测条件,利用多反应监测(MRM)技术对目标代谢物进行准确的定性定量分析。相对于高通量代谢组分析,定制靶向开发具有特异性强,灵敏度高和定量准确等特点。
图1 SRM和MRM原理图(图片来源于Bioanalysis Zone)。
1
、定性准
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利用标准品对目标代谢物进行定性定量,参考标准品的二级谱图确保了对目标代谢物的精确识别。
2、定量准
:
利用标准曲线定量,确保每个项目的定量结果准确。
3、重现性好
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采用MRM技术通过筛选目标物质的前体离子和特征碎片离子,有效排除非目标离子干扰,使定量更为精确,重复性更好。
4、质控
严格
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采用严格的QC系统,保证每个项目的定性定量结果。
5、灵敏度高
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基于TSQ Altis Plus
LC-MS/MS,灵敏度可达pg级。
6、经验丰富
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开发团队具有植物激素、花青素、黄酮、氨基酸等靶向物质开发经验。
2024年4月9日,中国农业科学院作物科学研究所作物基因与分子设计中心徐兆师团队在
Plant Biotechnology Journal
(
IF:10.1)在线发表了题为“Soybean steroids improve crop abiotic stress tolerance and increase yield”的研究论文。在本研究中,作者通过RNA-seq、靶向代谢组、遗传转化技术发现大豆NF-Y转录因子,能够激活
SQE1
的表达并维持其在干旱和盐胁迫条件下的酶活性,从而使转基因大豆植株在胁迫条件下拥有高水平的甾醇类化合物,进而提升转基因植株的抗氧化能力使其含有较高的抗逆属性。此外,田间试验表明,在大豆中过表达
SQE1
可以增强大豆的抗旱能力,且转基因大豆在干旱条件下表现出单株产量提高以及籽粒饱满度和茎基部周长增加。
图2 NF-Y-SQE模块与大豆固醇提高植物抗逆性的模型(Yu et al., 2024)。
1、植物营养品质的研究
2、植物生长发育的研究
3、生物胁迫与非生物胁迫的研究
4、物质合成通路的解析
图3 靶向开发实验流程图。
1、实验周期为1-3个月不等,具体以评估为准。
2、交付结果包括:完整的结题报告和实验原始数据。
Tips1
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客户下单及项目信息填写
在我司官网https://www.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:
1、要检测物质的名称、CAS号、标准品等基本信息;
2、样品来源、含量、状态等信息。
Tips
2
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实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印。
Tai-Fei Yu, Ze-Hao Hou, Hai-Long Wang et al. Soybean steroids improve crop abiotic stress tolerance and increase yield[J].
Plant Biotechnology Journal
, 2024, 22: 2333–2347.