推荐 | TBtools的两种使用模式-界面化和命令行

生信石头 · 公众号 · · 2025-03-10 20:19

正文

原标题：「启动 TBtools 软件 - 界面模式和命令行模式」

界面化功能

快捷启动

1. 使用安装器安装 TBtools，Windows 或 MacOS 均可以简单找到软件启动图标位置。

双击打开即可。

2. TBtools 绝大多数功能是原生 Java 代码开发。对于不喜欢安装器安装软件的朋友，也可以下载 Jar 文件，直接从 Jar 文件启动（但不建议）。如果环境中已经有 Java Runtime Environment ，且已经有文件关联，那么也可以直接双击 Jar 文件，打开 TBtools 程序。 这种模式下，推荐预先安装Java11或以上版本。

命令行启动

一般情况下，不建议也不需要从命令行启动 TBtools 的界面化接口。不过用户仍然可以选择，尤其是在系统没有 Jar 文件与 JRE 环境关联时。启动方式简单，大体如下

java -jar Pathto/TBtools_JRE1.6.jar

不带任何参数，即可启动界面化接口

命令行功能

尽管绝大多数公开资料显示“TBtools是一款界面化软件”，但事实上，TBtools 不是一款界面化软件。对于高阶用户，完全可以在终端直接使用 TBtools 的命令行模式，从而实现大规模数据的批量处理，如：在Linux下，基于400多个物种的基因组序列文件和基因结构注释信息文件，提取对应的 CDS 或启动子序列集合。

调用命令行结果非常简单，可以通过下述模式，检索可调用的命令行功能。