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分析中国新型冠状病毒 |《自然》论文

NaturePortfolio  · 公众号  · 科研  · 2020-02-04 10:11

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《自然》在线发表的一篇论文A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin对最近在中国引发呼吸系统疾病爆发的一种新型冠状病毒进行了鉴定和表征,揭示了其与严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒的相似性。这篇分析文章发现了新型冠状病毒来源于蝙蝠的证据,但是此次爆发的动物来源尚待确认。


冠状病毒一直是人类传染病流行的一个来源,如SARS和中东呼吸综合征(MERS)都是由冠状病毒引起。SARS相关的冠状病毒主要是在蝙蝠等哺乳动物体内被发现的,对公共健康构成了潜在威胁。据报道截至2019年12月,呼吸道疾病疫情已爆发,起源或为中国湖北省武汉市一海鲜市场。患者症状包括发烧、气促和肺炎。此后疫情已蔓延至中国其他地区及海外,截至发稿时,已发现超过14,000例病例,死亡人数超过300。


中国中科院武汉病毒研究所的石正丽及其同事分析了7例重症肺炎患者的样本,其中6人为武汉海鲜市场内的工人,该海鲜市场在2019年12月已首次发现病例。研究者发现在其中5名病人身上获取的全长度基因组序列彼此之间几乎完全一致(相似度超过99.9%),与SARS冠状病毒有79.5%的序列一致。此外,研究人员发现该病毒序列与一种蝙蝠冠状病毒在全基因组水平上相似度高达96%,表明蝙蝠可能是该冠状病毒的来源。


研究人员发现七个被鉴定和测序出的非结构性蛋白也存在于SARS冠状病毒中,表明该病毒是一种与SARS相关的冠状病毒,作者暂时将其命名为新型冠状病毒2019(2019-nCoV)。他们确认了2019-nCoV进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,即通过ACE2细胞受体。从感染2019-nCoV的病人体内分理出的抗体显示出在低血清稀释度下中和病毒的潜力,但是抗SARS病毒抗体是否能与2019-CoV交叉反应,仍需用从SARS病毒感染中痊愈的病人的血清来确认。


作者开发出了一种可以将2019-nCoV与其他所有人类冠状病毒区分开的测试,并展示在最初的口腔拭子样本中检测到了2019-nCoV,但随后(大约十天后)采集的样本没有显示阳性病毒结果。这项发现表明,最有可能的病毒传播途径是通过个体的呼吸道,不过作者也指出其他途径亦不无可能,仍需更多患者数据来进一步研究传播途径。


*支撑该研究发现的测序数据可在GISAID中找到,登记号为EPI_ISL_402124、EPI_ISL_402127-402130以及EPI_ISL_402131。*

© nature

Nature | DOI: 10.1038/s41586-020-2012-7


点击阅读原文阅读英文论文原文

A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin


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