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无需搞代码,照样轻松绘图

VG生信软件  · 公众号  ·  · 2017-09-27 17:31

正文

Excel制作热图



1、在Excel中选中要做热图的全部数据 ( 只选数值部分 ),执行开始菜单操作:“条件格式”——“色阶”——“其他规则”

弹出窗口后。默认为“双色刻度”,可改为“三色刻度”




2、选中三色刻度后,设置最小值、中间值、最大值的类型和颜色



注意:

此处颜色选择可以在第一步色阶里直接选择自己喜欢的。

建议将类型都改为“数字”,好处是可以自定义最小值、中间值、最大值的数值大小。

设置的 数据应在最小值,最大值范围内。例如此处数据范围84-116,故可设置最小值为80,最大值120,中间值可设为两者的中位数100。



将预览后面的色条截取到Excel表格中。截取效果如下:



3、若觉得 上图中 ,色条长度过长,可以选中色条进行调整,选中后会出现小方块,可以调节色条的宽度、长度。



4、为了美观,可以将Excel中的边框去除。


选中目标——鼠标右键——选中“设置单元格格式”——弹出对话框——选中

“填充”——选中背景颜色为无色即可。例如上面例子:



同理,将行的表格边框去除,最终,得到如上效果。


5、若觉得上面的数字放在上面不美观,可以进行如下操作去除数字。

选中数字目标区域——鼠标右键——设置单元格格式——选中“数字”——选中分类中的“自定义”——在类型输入两个分号(;;)--点击确定


图解继续用上面例子说明,如下:



6、最后,得到如下效果图,到此,热图的制作就完成了。(注意,可根据具体情况调节行高、列高)是不是相当灵活简单呢?





Graphpad Prism 绘制热图


1、打开GraphPad Prism 7.0软件,New table &graph,选择Grouped



选择“ Enter and plot a signle Y value for each point ”,Create



2、输入数据:


在Data Table中输入数据,GoupA——F是不同基因在不同组织(Heart、Lung、liver、Brain……)中的表达情况:



3、进入Graphs下,可以看见步骤2输入的数据Data1的图形,将进入Change Graph Type界面,Graph family为Grouped不需改动,选择Heat Map,在下面有四种热图的配色可以进行选择和预览,在此以选定第一个为例,点击OK



4、绘制热图的基本效果如下图:

此时,横坐标显示为ABCDEF,纵坐标显示123456,点击横坐标,进入Format Graph,Titles&Labels界面:



将Row Lables和Column Lables分别选择为对应的Row titles和Column titles,点击OK。



得到以下图片:



这时发现Gene1-6相邻且太过紧密,可以进行如下调节:重新点击横坐标,进入Format Graph,Titles&Labels界面,将Column Labels中的Column titles的角度由水平改为Angled(45 degrees),点击OK。



最终效果如下,导出图片即可。



快答

1)如何更改热图颜色配置?


双击热图,进入Format Graph界面,此时的颜色配置为Colormap








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