“纯生信”又成黑马！安徽医科大学本科生一作直冲1区14.3分！“免费数据库+双疾病分析”竟有如此汹涌澎湃的反响！跪服！

哈喽，小伙伴们！天气越来越热，你有没有和木木一样对科研的热情越来越高涨呢！木木可是斗志昂扬啊，尤其是看到了这篇由 本科生 发表在Journal of Infection的文章之后！！

《Journal of Infection》可是一本国际同行评审的医学期刊，其专注于传染病学领域的研究，涵盖了广泛的传染病学主题，包括但不限于细菌、病毒、寄生虫和真菌感染，以及感染的预防、诊断、治疗和流行病学。影响因子更是高达 医学(1区)14.3分 （投稿对于咱们科研人也是一门必修课哦，木木对各类杂志都有深入了解，如果你想知道你适合投稿什么类型的期刊，就快来木木这里寻找答案吧！） 。今天的这篇由安徽医科大学第一临床医学院本科生团队发表在Journal of Infection的文章着实令木木忍不住叹息，后浪推前浪呀！那么这篇文章的闪光点在哪里呢？一起来看！

1、通过 血液转录组分析 ，这篇文章对严重COVID-19和系统性红斑狼疮（SLE）进行了 跨疾病的比较 ，这是一种较少见的研究方法，有助于揭示不同疾病间的潜在联系。

2、利用 STRING数据库、Cytoscape软件 等生物信息学工具和算法筛选出关键的枢纽基因，并构建了 转录因子-miRNA-枢纽基因网络 ，为理解这些基因在疾病中的调控机制提供了 新的视角 。

新颖的选题、严谨的思路、恰当的研究方法、出彩的研究结果是构成高质量文章缺一不可的元素！每一个环节都需要我们精心去思考、去打磨哦！文章中用到的各种生信分析工具和算法，木木都非常熟悉，有想复现的小伙伴，抓紧时间关注木木吧！木木将给你的研究带来巨大的助力！

题目 ： 血液转录组分析揭示重症新冠肺炎与系统性红斑狼疮之间的串扰

杂志 ：Journal of Infection

影响因子 ：IF=14.3

发表时间 ：2023年4月

研究背景

研究表明炎症小体的激活和细胞焦亡在系统性红斑狼疮(SLE)中发挥作用。多项研究报告称，SLE患者可能有更高的严重COVID-19风险，而COVID-19个体患SLE的风险明显更高。严重COVID-19和SLE似乎有着很强的联系；然而，潜在的分子机制尚不清楚。

数据来源

研究思路

通过血液转录组分析，识别和比较严重COVID-19与系统性红斑狼疮（SLE）患者之间的差异表达基因（DEGs），然后利用基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析来探究这些DEGs的生物学功能和参与的途径，进而筛选出关键基因，并构建转录因子-miRNA-关键基因网络，以揭示严重COVID-19与SLE之间的分子交互作用和调控机制。

主要结果

1.识别和可视化严重COVID-19和SLE的DEG

研究者从54名患有严重COVID-19的患者中选择了4920个DEGs，包括2310个上调基因和2610个下调基因（图1A）。此外，从292名SLE患者中鉴定出总共1448个DEGs，包括377个上调基因和694个下调基因（图1B）。然后，研究者取选定DEG的交集，共获得272个基因（图1C）。为了揭示这些DEG的潜在功能，研究者进行了 GO和KEGG富集分析 ，发现DEGs主要参与免疫系统过程、多生物途径、免疫反应和转录因子结合，并与细胞质和线粒体有关（图1D）；与细胞因子-细胞因子受体相互作用、甲型流感、Th17细胞分化等通路（图1E）。

图1 识别和可视化严重COVID-19和SLE的DEG

2.识别COVID-19和SLE数据集中的关键基因并构建转录因子(TF)-miRNA-hub基因网络

为了进一步筛选影响重症COVID-19与SLE相互作用的关键基因，研究者使用 STRING和Cytoscape ，利用CytoHubba插件的 六种拓扑算法 筛选出前20个hub基因，并得到它们的交集（图2A）。 GO富集分析 显示，这些基因在防御反应、先天免疫反应等过程发挥作用（图2B）。 KEGG通路富集分析 显示，这些基因主要参与免疫和感染相关通路（图2C）。此外，研究者在重症COVID-19和SLE数据集中验证了这17个DEGs的表达，发现与健康个体相比，这些基因在重症COVID-19队列和SLE队列中的表达均显着升高（图2D,E）。研究者还通过 NetworkAnalyst 构建了一个TF-miRNA-hub基因网络来展示潜在的调控机制（图2F）。

图2 识别COVID-19和SLE数据集中的关键基因并构建TF-miRNA-hub基因网络

文章小结

这篇文章通过 血液转录组分析 揭示了严重COVID-19与SLE之间的分子交互作用，识别了 关键基因和潜在的生物标志物 ，为这两种疾病的精确诊断和治疗提供了新的见解。 耀眼夺目的文章往往都有自己的“灵性” ，经典的研究思路，常规的研究方法依旧发表1区14.3分，靠的就是 研究思路的新颖和研究切入点的犀利 ！ 这一点“灵性”让人眼前一亮，何愁发不了高分呢！如果你也想自己的文章有这样的“灵性”之处，不妨关注木木哦，木木期待看到你的提升！