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昨天分享的科研科研CP“cGAS/STING+线粒体自噬”大家学的怎么样了?思路可一定得理清楚哈~今天咋们继续趁热打铁,再来一篇cGAS-STING信号通路相关文章,这篇文章又有新的发现了,快来做第一个吃螃蟹的人吧。
2023年11月,德国乌尔姆大学医学中心分子病毒学
研究所的Konstantin团队在
顶刊Nature Communications上发表了题为ARF1 prevents aberrant type I interferon induction by regulating STING activation and recycling的研究论文,该研究揭示了ARF1在cGAS-STING激活和信号终止中的作用。研究利用高通量测序技术、生物信息学工具、免疫共沉淀和质谱分析技术及共聚焦显微镜和超分辨率显微镜技术,进行分析和评估,极大地增加了结果的可靠性。
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题目
:RF1通过调节STING的激活和循环来阻止I型干扰素的异常诱导
发表时间:
202
3
年
11
月
研究
背景
cGAS-STING信号通路在调控多种细胞功能及人类疾病发生中起着关键作用,尤其是在免疫应答和炎症反应中。ARF1是一种小GTP酶,研究发现其突变(如R99C)与I型干扰素病相关,突变导致ARF1的GTP酶活性降低,从而影响cGAS-STING信号通路的正常功能。
研究
主要
结果
展示
1.
ARF1突变定义为I型干扰素病
在一个患有冻疮狼疮皮肤病的患者(AGS460)样本中,发现在ARF1中存在新生c.295C>T/ p.(R99C)替代突变,并通过进一步研究发现ARF1中99号位置精氨酸的突变是一种以前未被识别的人类I型干扰素病的基础。
(a–g)9岁AGS460的手部(a)和面部(b)出现红斑性
血管炎冻疮样病变,同一患者18岁时的右手显示明显的组织损失(c),患者RH2003(d,e)和KW2022(f,g)的手和脚上也观察到类似的病变,年龄分别为18岁和2岁;
(h)ARF1结构域结构示意图。残基R99用红色箭头表示;
(i)多重序列比对显示指定物种中ARF1残基R99的保守性;
(
j
)患者AGS3133的ISG概况(红色)与27名健康捐赠者的平均ISG概况(蓝色)。
2.
ARF1 R99C诱导STING依赖性I型IFN激活
在稳定表达STING(293-23-R232)的HEK293细胞中发现,ARF1 R99C的瞬时表达足以诱导剂量依赖的I型IFN信号传导,且
99位点的任何替代都会导致慢性I型IFN释放,ARF1 R99C诱导I型IFN信号通路需要STING,
内源性cGAS-STING蛋白足以诱导信号传导
。
与ARF1 R99C
共转染
后进一步研究发现,内源性STING蛋白数量的减少与STING激活导致的降解相一致,患者样品的研究结果再次验证了这一点
。
(a)
瞬时表达FLAG标记的ARF1 WT、R99C、Q71L或T31N的293-Dual-hSTING-R232细胞中SEAP报告基因的ISRE启动子活性(转染后32小时并标准化为细胞活力),下图:用抗FLAG染色的全细胞裂解物(WCL)的相应免疫印迹;
(b)
(a)中数据的曲线下面积分析;
(c)
在瞬时表达STING(+STING)或空载体(-STING)以及FLAG标记的ARF1 WT和R99C的HEK293T细胞中,通过Firefly荧光素酶(Fluc)定量测定ISRE启动子活性(转染后32小时,并标准化为GAPDH-海肾荧光素酶)。下图:抗FLAG染色的WCL的相应免疫印迹;
(d-
e
)
用ARF1 WT和R99C转导的A549 Dual细胞中的ISRE (d)或NF-κB (e)启动子活性,下图:用抗FLAG、抗STING和抗GAPDH染色的WCL的相应免疫印迹;
(
f
)瞬时表达指定ARF1构建体、cGAS和STING的HEK293T WCL的示例性免疫印迹,印迹用抗pTBK1、抗TBK1、抗IRF3、抗FLAG和抗GAPDH染色;
(
g
)(
f
)中pTBK1带强度的量化,标准化为TBK1;
(
h
)转导后72小时转导表达ARF1 WT和R99C的原代正常人肺成纤维细胞中OAS1 mRNA的qPCR,下图:用抗FLAG、抗STING和抗GAPDH染色的WCL的相应免疫印迹
;
(i)将来自健康供体(n1、f1)或患者(AGS460)的原代成纤维细胞的上清液(SN)转移至293-Dual-hSTING-R232细胞,转移后48小时SEAP (ISRE)活性并标准化为细胞活力。
3.
ARF1 R99C破坏线粒体,将mtDNA释放到细胞质中
在WT和cGAS-KO的THP-1单核细胞中通过慢病毒转导表达ARF1 WT和R99C,发现IFN信号仅在cGAS存在的情况下被诱导,表明
cGAS促进了ARF1 R99C诱导的I型IFN信号转导
。电镜显示ARF1 R99C存在时线粒体被破坏,R99c表达细胞的线粒体中可见小的电子致密颗粒,提示线粒体损伤。在mtDNA缺失后,ARF1 R99C表达诱导的IFNB1、Mx1和RSAD2的表达也降低了。这些数据表明ARF1 R99C的表达促进线粒体结构异常和mtDNA的释放以及cGAS的激活,最终诱导ISG的异常激活。
进一步电镜分析发现,在ARF1 R99C的存在下,线粒体分支长度增加,线粒体融合标记物MFN1在ARF1 R99C存在时显著积累,而在ARF1 WT中没有积累。在酵母中,进一步表明ARF1 R99C通过MFN1的积累促进线粒体的超灌注,导致mtDNA渗漏到细胞质中。
(a)
ISRE启动子活性通过转导表达ARF1 WT或R99C的THP-1-Dual WT(灰色)或cGAS KO(粉色)中的Lucia荧光素酶(LLuc)进行定量,下图:抗FLAG、抗STING、抗cGAS和抗GAPDH染色的WCL的相应免疫印迹;
(b)
瞬时表达ARF1 WT或R99C的HEK293T细胞的示例性电子显微镜分析;
(c)
示例性免疫印迹显示瞬时表达ARF1 WT、R99C、Q71L或载体的HEK293T细胞的分级;
(d)
(c)胞质部分中mtDNA (MT-D-Loop)的qPCR;
(e)
健康供体(n2、f1、I7)或患者(AGS460)的原代成纤维细胞胞质部分中mtDNA (MT-D-Loop)相对于总标准化细胞mtDNA(mtDNA/核 DNA)的qPCR;
(
f
)对稳定表达STING并通过ddC或未经处理(NT)耗尽mtDNA的U2OS细胞中的OAS1 mRNA进行qPCR;
(
g
)瞬时表达TagRFP标记的ARF1 WT、R99C或载体对照(红色)的HeLa细胞的示例性活细胞共焦激光扫描显微镜图像;
(
h
)分析图像的周长、圆度、分支长度(每个细胞)和分支(每个细胞)
;
(i)瞬时表达ARF1 WT、R99C或载体的HEK293T细胞的WCL免疫印迹示例,印迹用抗MFN1、抗RHOT1、抗FLAG和抗GAPDH染色;
(
j
)对瞬时表达ARF1 WT、R99C或载体对照的HEK293T细胞胞浆部分中的mtDNA (MT-D-Loop) 进行qPCR,以及标准化为细胞mtDNA(mtDNA/核 DNA)的VCP。
4.
R99突变会损害ARF1 GTP酶活性以及与COPI复合物的关联
结构分析显示,R99残基并不直接参与与GTP或其他ARF1相互作用伙伴的结合;亲和蛋白分析显示,R99C突变显著降低了与COPI通路蛋白的相互作用。
上述结果表明,R99C降低了构象稳定性、GTPase活性以及ARF1与COPI复合物组分的关联性。
(a)
ARF1 (PDB: 2J59) ATP结合模型(橙色/黄色),R99和D26突出显示;
(b-c)
ARF1 WT (b)或R99C (c)与GTP的相互作用以及通过荧光热位移测定分析的蛋白质稳定性;
(d)
从表达FLAG-ARF1的HEK293T细胞中纯化得到的所示ARF1突变体的GTP酶活性,下图:用抗FLAG染色的相应免疫印迹;
(e)
通过瞬时表达ARF1 WT或R99C的SEAP定量293-Dual-hSTING-R232细胞中的ISRE启动子活性,并指示GEF或GAP标准化为细胞活力。用抗HA、抗-turboGFP (tGFP)、抗-FLAG、抗-STING和抗-GAPDH染色的WCL的相应免疫印迹;
(