蛋白数据知多少？

UniProt（全称Universal Protein），它整合了三大数据（Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD ）的数据。是目前信息最丰富、资源最广的免费蛋白质数据库。

首先看一下主页，大致分为5个部分， 1、UniProtKB；2、UniRef；3、UNIParc；4、Proteomics；5、Supporting data。

UniProtKB（Universal Protein Knowledge base）它是经过专家校验的数据集

以小鼠基因BCL2为例，简单介绍一下数据库功能。

点击search后，进入数据库，左侧是基因蛋白数据相关信息，包括功能、亚细胞定位、参与通路、组织表达、互作蛋白、结构与功能域等等。

基因功能部分，可以看到对基因概括描述以及GO数据库信息，（1）细胞学组件（2） 分子功能（3）生物学途径三个方面介绍基因功能。

蛋白在细胞内定位

蛋白参与的生物学过程,同时数据库提供了氨基酸修饰位点以及参与的转录后修饰过程。 

蛋白的三级结构以及内含的模体结构与位置以及包含的功能域。

UniProtKB（Universal Protein Knowledge base）它是经过专家校验的数据集

以小鼠基因BCL2为例，简单介绍一下数据库功能。

二．主页上方有五个选项，分别是BLAST、Align、Download、Add to basket、History. 

1.BLAST: 这个按钮可以让你用感兴趣的蛋白质序列做BLAST分析，输入基因序列

搜索哪些蛋白质的氨基酸序列与你感兴趣的蛋白质相同或相似，预测这个蛋白具有哪些生物系功能以及蛋白的空间结构。

2.Align:以让你对多个蛋白质的序列之间进行相似性比对，方便找到蛋白之间的结构保守区域，根据蛋白质的相似性，分析蛋白间的亲缘关系，进化的先后顺序等。

3.Download：下载蛋白的序列数据，支持FASTA，Text，Excel，XML，List等。

4. Add to basket:将感兴趣的蛋白质加入以备后期使用。

5. History:查询历史。

BioGeek_Syngentech