专栏名称: 生信菜鸟团
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确定不看一下MIT的癌症数据团队吗?

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2021-02-08 22:02

正文

01.

平台简介

麻省理工学院和哈佛大学的博德研究所成立于2004年,目的是通过利用基因组学增进人们对生物学和人类疾病治疗的理解,从而改善人类健康,并为新一代疗法奠定基础。哈佛医学院的科学家于1998年成立了化学与细胞生物学研究所(ICCB),以促进将化学遗传学作为一门学科和进一步了解人类生物学与疾病的工具。2002年,ICCB获得了美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)的化学遗传学计划(ICG)资助,其成功的研究者发起的筛查计划为全球80多个研究小组提供了小分子筛查项目。 与诺奖擦肩而过的科学家张锋正是博德研究所的年轻主任。 博德研究所 拥有各种专业知识和背景的人才,为解决棘手的科学问题创造了丰富的协作环境。我们一直在 研究,计算生物学,软件工程和行政管理领域 寻找新的团队成员,以帮助我们在科学的前沿解决重要问题。目前他们 正在寻找一位出色的生物信息学工程师 加入Broad Institute的 癌症数据科学团队

在这个岗位中,您将帮助 建立,维护和运行用于Cancer Dependency Map Project https://depmap.org )并构建、维护和运行顶尖的computational pipelines。



02.

实验室研究简介

博德研究所癌症数据(Cancer data Science)实验室:

(1)建立预测模型,从 肿瘤和癌细胞系的基因组图谱 预测癌症的脆弱之处。

(2)整合了 功能性筛选和组学数据 ,以确定新的癌症靶点以及重新利用的药物。

(3)开发计算方法和工具来 促进癌症模型中CRISPR筛查 的分析。

(4)分析来自 PRISM平台 的高度复合的小分子筛选数据 ,以发现新的癌症治疗线索。


研究所博客

http://cancerdatascience.org/blog/

由各位一线科研大佬写的数据科学博客,在它的简介上这样写到:我们进行了大量的观察:关于什么有效,什么无效,什么分析可以依赖,哪些分析是误导性的。我们计划使用此空间以一种简单的语言来传达我们对数据所注意到的内容以及我们建议您如何考虑和处理它。


03.

团队主要成员

欢迎移步:http://cancerdatascience.org/#projects


Publications:

欢迎移步: http://cancerdatascience.org/#projects


04.

申请流程与要求

岗位职责:

  • 提供原代码, 构建和维护适 用于各种数据类型的 生物信息学pipelines

  • 运行数据处理的pipelines以保证数千名研究人员 大规模基因组数据集 的研究需求

  • 与研究和软件开发团队紧密合作

  • 维护和组织计算基础架构和资源

  • 参与大规模分析,出版物和计算工具的开发。


能力需求:

  • 计算机科学、计算生物学或相关领域理学学士或硕士学位, 2年以上生物信息学应用经验

  • 现有生物信息学分析工具、方法和数据库的实践经验,包括下一代测序分析

  • 具有科学计算工具(如R)、标准编程语言(如java、C++、Python)和编写健壮软件的实际经验

  • 较强的组织/规划能力和对细节的关注

  • 有计算分析、算法开发和统计方面的经验

  • 以下任何一项都是加分: 熟悉云环境,如GCP或AWS。在Unix/Linux环境下工作的经验,包括基本的shell脚本。









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