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成像质谱流式?妙啊!

生命科学产业观察  · 公众号  ·  · 2024-06-20 08:25

正文

有观点,有态度
这是生命科学产业观察公众号的第 1046-4 期文章
来源:循因缉药

免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)简称免疫组化和免疫荧光(Immunofluorescence, IF)大家都很熟悉了。


那么,IMC大家知道么?



缘起




我手里拿着一份Standard BioTools(ticker:LAB)2024Q1的财报,然而我一点都看不下去。


原因很简单,这是Standard BioTools和 SomaLogic 合并后第一个季度的数据, 因为合并有很多业务的变动,对比起来根本没什么意思。


主打一个他们怎么说,你就怎么看。



比如这个合并后的营收4600万美元,而Somalogic 2023Q1公司营收2037.9万美元,Standard LabTools 2023Q1的营收是2510万美元。


增长 有点寂寞。


所以咱们干脆不看了吧,只留个彩蛋放到最后,Q2的时候咱们直接看环比得了。


那么总得聊点这个公司的东西吧,于是我决定聊聊他们家蛋白组学的东西。



mIHC/mIF的限制


经常做IHC/IF的都知道,单重的IHC/IF非常简单,都是成熟protocol。


无非是抗体选一选,稀释浓度调一调,并不复杂。


但是,一旦进入multiplex的领域也就是多重免疫应光(mIHC/mIF),问题就来了。



这里面包含3个方面的问题。


第一,不同荧光信号之间的串扰。


你要做多重,就得用多色应光,就一定会面临荧光信号串扰的问题。


Akoya声称自己的一个牛X的技术就是自家专有的荧光,以及配套的抗信号串扰技术(unmixing)。


第二,时间开销过长。


要想提升检测的靶标数量,使用不同荧光信号是必然。


然而,还不够,毕竟荧光通道有限。


还得多次染色,最后进行叠加,而这就造成了mIHC/ mIF 的时间被拉长。


且,靶标越多,时间越长。


第三,检测靶标扩充困难。


这其实是第一和第二条的一个推论,由于荧光信号和时间开销的限制,mIHC/mIF的检测靶标数量必然受到影响。


还有一个不容忽视的问题就是多轮洗脱下来可能出现脱片等情况,影响实验顺利完成。


当然,这里面还有抗体的问题,大家都会遇到就不展开了。


Akoya的100-plex吆喝了很久不知道哪位大佬用过,反倒是5-plex的更为常见不知道是不是这几个原因呢?


综上,有没有一种更好的解决方法呢?



IMC?妙啊



还真有。


Standard BioTools就想到了一个好办法,用质谱啊。


当然,这并不新鲜,因为Bruker也是这么想的。


只不过,Bruker比较简单粗暴,直接上了MALDI(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization,基质辅助激光解吸/电离)。



这不掏上了么?理论上质谱能够检测的蛋白几乎是无限的。


什么多重免疫荧光,都是弟弟。


当然,这是有代价的,主要就是分辨率不够。



这时,大聪明Standard BioTools就想了个绝妙的主意。


要是我把流式跟质谱结合起来,是不是有搞头?


唉,你还真别说。



这货是怎么做的呢?


这事说起来简单,其实一点也不复杂。



只要4步,就可以既利用免疫检测的优势,又利用质谱的优势。


1.使用与不同稀土金属偶联的多种抗体对组织切片进行标记;


2.在 Hyperion组织质谱成像组件中通过 脉冲激光 进行组织消融;


3.气化的样品通过惰性气体的等离子体流被驱动到 CyTOF 质谱仪的质量检测器进行分析,重建组织以及与每个检测点丰度的关联性;


4.通过不同的软件进行信号(图像)分析和重叠。


这里面的关键就是人家检测的是抗体上面带的稀土偶联物标签。


这带来很多的好处,比如目前Standard BioTools已经能够提供40-plex的金属标签,能够同时一次扫描所有的标签而无需多个循环,节约了时间。







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