是什么让一篇博士生的10.7分SCI文章，变得逻辑不通？！看了这上海交大的巨噬细胞文章，我只能说，这算是验证了个什么……

如果想要科研的推理过程更为严谨，那就需要在推理的过程中，符合逻辑。如果在验证的过程，并不能证明所要解释的命题，那这篇文章就会变得不可信。今天讲的这篇文章虽然发表在10.7分的Redox Biol上，看着做得实验满满登登，但由于都没有切中要害，导致这篇文章得到的结果并不严谨（ 科研课题的推进，需要通过不断地假设和迭代，对于命题也需要缩小各个概念的外延来进行论证，否则就会产生肯定后件或是中项不周延的逻辑谬误，造成结果的不严谨，不清楚的话可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列 ）。我们就来看看这篇上海交通大学医学院附属仁济医院的文章，是怎么样不严谨的吧：

这篇文章做的是Dvl2（ 要是还记得Wnt信号通路的话，应该知道Dvl可以于GSK3β和β-Catenin形成复合体，并抑制GSK3β，从而影响Wnt信号通路，不清楚的话，可以回去看看《信号通路是什么鬼？》系列复习下 ），他们发现Dvl2在巨噬细胞中特异性敲除后，会导致肝脏的IR（缺血再灌注）损伤中受到影响加剧。在IR的过程中，髓系细胞特异性缺失Dvl2后，炎性分子的表达增多，而GSDMD导致的焦亡增强：

通过二代测序，他们发现巨噬细胞的Dvl2缺失后，IR应激导致的YAP和HSF1相关的靶基因表达下调，同时NOD1的表达被激活（ 这也就说明了Hippo信号通路在Dvl2缺失后受到了抑制，而NOD样受体信号通路可能得到了激活，这两个信号通路都是比较常见的信号通路，不熟悉的话，可以去看看《信号通路是什么鬼？》系列 ）。这里通过巨噬细胞缺失了Dvl2后，YAP和HSF1的入核率来确定了Dvl2对于该信号通路的影响，实际上这也只能作为间接作用：

在这之后，他们对巨噬细胞特异性敲除了YAP。以此证明IR刺激后，Hippo信号通路的YAP的抑制，对于NOD1介导的炎症和焦亡是必须的。但如果对科研的逻辑，有一定的了解的话，应该能看得出来，这里其实并不严谨。因为YAP的敲除，和受到Dvl2影响导致的YAP入核率下降以及磷酸化抑制，并不是一回事（ 命题中的概念产生了误差，就会导致验证的过程中产生逻辑谬误，而这样的YAP直接敲减，只会造成肯定后件的逻辑谬误，不熟悉的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列 ）：

他们也发现Dvl2的缺失，抑制了YAP于HSF1的互作，影响了两者在核内的共定位。而炎症因子的表达也在Dvl2缺失后，得到了激活。其实这里也不好说明什么问题，毕竟本身缺失Dvl2后YAP和HSF1的入核率就下降了，这也可能是造成不能共定位的原因，而这里炎症因子在YAP和HSF1无法入核的情况下，表达增高，也说明了这可能又存在一种间接的抑制作用：

那么这个简介的抑制作用又是说明呢？他们分析了YAP和HSF1所结合的启动子区域，发现YAP和HSF1能结合eEF2的启动子，而eEF2可能可以抑制NOD1及下游的炎性分子表达，他们在这里试图使用柯霍氏法则来验证过表达Dvl2后，敲除HSF1或YAP，对于下游eEF2的影响（ 这虽然是柯霍氏法则的验证，也就是移除某个关键分子，验证对于下游基因表达或者表型的影响，但实际上这里的验证并没有切中要害，直接敲减YAP或者HSF1，会造成肯定后件的逻辑谬误，不清楚柯霍氏法则或者肯定后件逻辑谬误的话，可以去看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》 ）：

于是他们按照原有的这种简单粗暴的思路，直接敲减了eEF2，以此来确定eEF2是巨噬细胞中Dvl2影响NOD1表达的关键（ 这里我都没有办法直接吐槽了，劝他可以先去买本《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》好好看看，先想清楚自己验证的到底是什么，如果验证HSF1及YAP对于eEF2的表达影响，就应该从eEF2的启动子上来进行验证，如果是要分析eEF2对于NOD1的抑制，就应该从NOD1和eEF2的结合来验证，否则无法得到现有的结果 ）：

由于他们认为eEF2的表达是Dvl2对于NOD1调控的关键，于是他们就构建了过表达eEF2的巨噬细胞，来进行会输，来明确对于IR后肝脏的影响，这里其实可以说，已经和有没有表达Dvl2无关了，完全是eEF2对于NOD1的功能了。虽然有一定的临床异意，但不多，对于机制而言，聊胜于无：

最后，就形成了这样的示意图，这种示意图上Dvl2对于下游的NOD1以及焦亡和炎症反应，都是虚线，只能说明可能存在间接作用，并不能说明一定是通过YAP/HSF1的影响，也不能说明一定是通过eEF2的影响。而eEF2和NOD1之间的关联，又是一层不确定的作用，所以这篇文章虽然10分多，也只是外行看个热闹：

好了，这篇文章总的来说内容是不少的，各个方面都做了很多，但实际上各个细节的验证，缺乏打磨，显得十分空洞，对于想要进行这方面研究的人来说，借鉴的意义不大。好了，今天就先策到这里吧，有兴趣的话可以一起批判性地看看原文，祝你们心明眼亮。

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