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《自然·医学》:预测肺腺癌脑转移的方法来了!科学家开发甲基化模型高准确度预测肺腺癌脑转移风险,可无创区分脑转移与其他脑肿瘤

奇点网  · 公众号  · 医学  · 2024-10-11 18:00

正文

*仅供医学专业人士阅读参考

肿瘤脑转移(BM)是脑癌的主要类型,是最危险的癌症结果之一。在医学技术已经进步的今天,脑转移的中位总生存(OS)仍然仅有10-16个月。肺腺癌(LUAD)是最常见的脑转移癌种,超过三成的肺腺癌患者最终会出现脑转移。


脑转移很隐秘,主要在患者因为头痛或神经系统症状就诊时被发现,但此时能做的治疗已经不多。但由于缺乏有效的预测生物标志物,我们也很难识别脑转移高风险患者,无从开展早期检测和治疗。


本周,多伦多综合医院及多伦多大学科研团队在《自然·医学》杂志发文,研究者们收集了四百余份肺腺癌患者的肿瘤和血浆样本,构建了肺腺癌DNA甲基化特征模型,用于预测患者的脑转移风险。


该模型预测效果不仅优于临床特征,还可以仅凭血浆甲基化标志物对脑转移和其他脑瘤进行准确区分,可以成为神经影像学难以处理的肿瘤的“照妖镜”

论文题图

研究者首先对166例原发肺腺癌临床注释队列进行了分析,综合详细临床数据筛选甲基化谱,共确定了5553个差异甲基化CpGs可以有效预测脑转移的发展,并依此构建了预测模型。

模型构建流程图

研究者在独立的验证队列中测试了模型效果,预测的患者脑转移高、中、低风险分层符合生存曲线,且效果独立于临床因素。

甲基化模型与其他基于临床数据的预测效果

整合临床预后因素后,模型可以更好地预测5年内脑转移的发展,AUROC高达0.82。


研究者还分别测试了不同疾病负担和分子亚型,甲基化模型都能起到不错的预测效果。

综合临床因素模型预测效果

研究者观察到,与脑转移密切相关的染色体和基因水平的拷贝数改变中,预测效果最强的有 8q23.2、21q21.3、ACTG2BLMFGFR3MCL1CCND1EGFRMDM2MYC,仅有后四者曾被报道。


脑转移与其他的脑肿瘤不易区分,研究者尝试通过血浆甲基化生物标志物鉴别脑转移和神经胶质瘤/CNS淋巴瘤等主要脑瘤类型,最终得到的模型AUROC达到0.8。

模型构建流程

不过该模型在肺鳞癌(LUSC)中表现不佳,说明肺鳞癌和肺腺癌之间存在较大的甲基化差异。


总而言之,在肺腺癌脑转移缺乏预测标志物的情况下,这项研究提供了一种高准确性的脑转移预测方法,尤其是无创鉴别脑转移和其他脑瘤,具有显著的临床价值。


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参考资料:

[1]https://www.nature.com/articles/s41591-024-03286-y

本文作者 | 代丝雨