专栏名称: 小张聊科研
聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。
目录
相关文章推荐
51好读  ›  专栏  ›  小张聊科研

如何用Image J 对Western blot 条带进行灰度分析

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2017-08-09 17:25

正文

请到「今天看啥」查看全文


Image J软件:Windows 版本

第一步:软件安装

1. 下载地址:http://rsb.info.nih.gov/ij/download.html

2. 下载windows 32位带Java版本,双击软件安装。

第二步:界面介绍

软件界面

第三步:图片分析

1.下图为样板图片

2. 导入图片:File> Open> Sample1.jpg

图片导入后,Sample1.jpg在新的窗口中打开


3. 图片类型设置:Image> Type> 8 bit


4. 去除图片背景:Process> Subtract Background> …


4.1 Subtract Background 窗口:Rolling ball radius 设为50 pixels,勾选light background,可选preview,点击“OK”确定


5. 工具栏:选择“矩形选框”

6. 最大化“Sample1.jpg”窗口,便于矩形选择,矩形选择第一个泳道

7. 标记“矩形选框”为1:矩形选择后,调整矩形至合适大小,按下数字键“1”,或者Analyze> Gels> Select Fist Lane。

8. 选择“泳道2”:拖动“1”的矩形框,会出现两个矩形选框,拖动矩形框至泳道2,调整位置,并按下数字键“2”,Image J 会自动调整大小使“矩形框2”与“矩形框1”保持同一水平。


9. 继续拖动,会出项新的“矩形选框”,调增至泳道3,并按下数字键“2”(注意:是按下数字键“2”),重复9至6个泳道全部选择。


10. 所有泳道选择后,按下数字键“3”,出现分析图谱。


11.“直线”封闭峰:工具栏选择“直线”,从起峰处至落峰处。

12. 计算峰值:工具栏> Wand(tracing) tool,点下刚才封闭的区域,峰值结果出现在新的窗口中。


计算结果:

12.其他泳道,以此类推


长按二维码识别关注“小张聊科研”

关注后获取《科研修炼手册》1、2、3、4、5,基金篇、生信特辑







请到「今天看啥」查看全文