这么多的钱能弄个啥样的课题呢?

我叫欧阳正义，嗯，这是我的第一次开题，所以我必须要跟我的老板好好商量一下。

老板：正义啊，这是你第一次开题呢，我给你设计了一个几乎完美的课题呢，是不是有点小兴奋啊！这课题是酱婶滴，首先先用二代测序或者基因芯片进行一轮分析，筛选出癌和癌旁的差异基因，嗯，没绰。

然后涅，你就会通过GO分析和Pathway分析，找到一些关键基因。

接着做一下蛋白互作的验证，嗯，没绰，这样的话就足以提高我们课题的档赤了，就要开展这样厉害的课题了，是不是有点小兴奋啊？

我：好的老板，被您说的我确实有点激动了呢！

老板：嗯，你这个课题十分要紧呢，所以我斥巨资拨了一笔钱作为你的经费，你年纪还轻，可能没见过那么多钱。

我：呃，真的就一张么……好吧……

谁叫我是欧阳正义呢，一百块钱儿的课题也没有办法难倒我的，我先去超市买了一百块钱儿的泡面找找灵感，嗯，就是酱婶滴……

说要做芯片或者测序，基本上是没戏，但是我们可以挖别人的数据，随便用几个R语言句子就OK了（之前讲过速成班的呢）。

这样的均一化还是很好做的。

接着，就需要做一些GO分析和Pathway分析，其实这个也不难，用这个就直接能做完了（之前讲过了，不知道就点这里）。

结果虽然是一堆，但是我们可以从分析结果中找出位于PPI Network核心的几个基因，沒绰，就是颜色最深的那几个：

然后多挑出来几组的核心基因，然后，跑一下STRING，验证一下：

就相当于是找到并且验证了这几个关键基因就是调控这种肿瘤的核心，是不是很完美很Esay……这样的文章发一两分应该没什么问题吧……哈哈哈……

不过，我还是高兴得太早了，可恶！这篇文章被印度人先发了……

只比我多做了点转录因子的预测，就发了Gene（IF=2.3），连图都跟我设想得一毛一样！不甘心呢！好吧，看来我要准备重新开题了。老板，能不能给我再来一百块钱儿的……

李莫愁博士：不花钱，不做实验，确实有这样的套路，也不算是投机取巧。有时候还是有点无奈的。肠癌的印度人发了，但是还有其他芯片可以挖呀。具体的分析，就看你自己了。但是如果在里面加上一些验证，可能会有更好的效果。好吧，祝福欧阳童鞋下次开题顺利，今天就先策到这里吧。

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老司机的R语言大概5分钟的速成班