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我们机体的肠道中居住着数以万亿计的细菌（肠道微生物），其能够帮助决定机体患癌的风险，以及对癌症疗法所产生的反应；每个人机体中特殊的肠道微生物菌群都同其免疫系统之间保持着持久的联系；而且肠道微生物对于确保机体免疫系统能否有效抵御疾病非常关键，比如流感，甚至更为严重的癌症等疾病。
目前研究人员正在通过研究来确定机体中特殊的肠道细菌如何能够帮助确定个体的患癌风险，以及是否“修改”肠道微生物的组成就能够帮助控制个体癌症的进展以及预测癌症患者对疗法所产生的反应。
你的肠道菌群
每个人的肠道菌群都是非常特殊的，其就好像指纹一样；在我们出生的最初几年里，这些肠道菌群都是可塑的，同时其也能够反映我们在出生时的一些状况。比如相比顺产的婴儿而言，经过剖腹产出生的婴儿机体中有益菌群的水平较低，而有害菌群的水平却较高；相比母乳喂养的婴儿而言，研究者也在人工喂养的婴儿机体中发现了类似的模式，这也就表明，通过饮食影响婴儿机体对细菌的暴露或许能够改变其早期机体中的肠道微生物组成。
然而研究人员并不清楚随着婴儿慢慢长大后期机体所发生的变化，但研究者们认为，通过剖腹产出生的婴儿不仅机体中含有不同种类的细菌，而且其很有可能患上过敏症和免疫系统相关的疾病，比如哮喘症等。
微生物群落和癌症风险
机体肠道和免疫系统之间存在着密切的关联，正如我们机体肠道菌群能够控制免疫系统一样，机体的免疫系统还能够控制肠道菌群，有研究表明，这种相互作用在决定个体患癌风险上扮演着关键的角色。
缺失特定免疫分子（抗炎性细胞因子）的小鼠往往免疫反应会变得迟缓，而且其机体肠道中有害细菌的水平较高，这意味着，强大的免疫反应能够确保有害细菌在肠道中的水平并不会太高。相比机体中抗炎性细胞因子水平充足的小鼠而言，这些小鼠同时对肠癌也较为易感，这种升高的癌症风险能够通过粪便移植而转移到正常小鼠机体中，这其中就包括从供体小鼠机体中收集粪便，随后移植到受体小鼠机体中。
来自供体小鼠机体中的粪便中含有能够反映其肠道菌群的细菌，这种高风险小鼠机体的粪便中含有许多有害细菌，一旦其被转移到受体小鼠机体后，这些细菌就会在受体小鼠肠道中迅速繁殖，并且改变受体小鼠肠道的微生物组成。研究人员通过研究发现，当新型的肠道菌群在受体小鼠机体中建立后，其患肠癌的风险就会增加。
最近一项在人类机体中进行的研究就得出了与上述研究平行的结果，而且研究者还发现，长期使用抗生素或许会增加个体患肠癌的风险。众所周知，抗生素能够干扰肠道菌群的组成，就好像在缺失抗炎性细胞因子小鼠机体的表现那样，最终会导致小鼠机体中有害细菌的水平升高以及患肠癌风险的增加。
肠道菌群和化疗
此前，一篇刊登在国际著名杂志Nature上的综述文章中，研究人员就阐明了肠道菌群在患者对化疗产生反应过程中所扮演的关键角色；研究者发现，肠道菌群能够以两种方式来确定化疗的效力，即通过激活化疗药物，或者是通过与机体免疫系统的相互作用。研究人员在缺失肠道菌群的小鼠中已经对上述机制进行了详细地描述了，诸如无菌小鼠，其在完全无菌的环境中进行繁殖，这些小鼠并没有暴露于外部的细菌中，而且其机体中的任何部分也不含有细菌。
有研究表明，相比正常小鼠而言，对无菌小鼠的化疗作用往往并不明显，而且无菌小鼠机体的肿瘤往往会发展迅速；这或许是因为化疗药物能够开启一种特殊的免疫反应，而这些免疫反应能够通过一种炎症过程来杀灭肿瘤细胞；这项研究中，研究者发现，相比正常小鼠而言，无菌小鼠在接受化疗后，其机体肿瘤中炎性标志物的水平较低。这就表明，肠道菌群和免疫系统之间的交流对于癌症疗法的成功性非常关键。
很多化疗药物都会以一种无活性的形式应用于患者机体中，随后这些药物就会被患者机体肝脏中的特殊酶类或者肠道菌群直接激活，不同水平的肝脏酶类往往会帮助决定有效的化疗方法如何对肿瘤细胞进行杀灭作用。相比正常小鼠而言，无菌小鼠的肝脏中含有大量负责对化疗药物进行解毒的肝脏酶类，因此其往往能够很快清除掉化疗药物的药效，这也就使得化疗药物无法有充足的时间来杀灭小鼠机体中的肿瘤细胞，并且也无法对药物的疗效进行调节了。
