本文的第一作者Robert Manguso是Haining实验室的研究生,设计了一个新型基因筛选系统,用于识别癌细胞用于逃避免疫攻击的基因。 Manguso使用CRISPR-Cas9,这是一种基因组编辑技术,它像一对分子剪刀一样在遗传密码中的精确位置切割DNA,以系统地敲除由黑素瘤皮肤癌细胞表达的2,368个基因。 Manguso然后能够识别哪些基因在被敲除时使癌细胞对PD-1抑制剂更易感。
Manguso开始通过工程化黑色素瘤皮肤癌细胞,使它们都含有Cas9,作为CRISPR编辑系统一部分的“切割”酶。然后,使用病毒作为递送载体,他用不同的遗传密码的“单导向RNA”序列对每个细胞进行编程。结合Cas9酶,sgRNA编码2,368个不同基因被敲除。
通过将肿瘤细胞注射到小鼠体内并用PD-1检查点抑制剂处理,Manguso能够计数修复的肿瘤细胞。
使用这种方法,Manguso和Haining首先证实了已经被认为是已经在临床试验中的免疫“逃避者”PD-L1和CD47的药物抑制剂的两种基因的相互作用。然后,他们发现了数种新的免疫逃避者,可以增强PD-1癌症免疫治疗。一个新发现的基因是Ptpn2。
“Ptpn2通常将制动器放在免疫信号通路上,否则会使癌细胞窒息,”Haining说。“敲除Ptpn2可以增加免疫信号通路,使肿瘤细胞生长较慢,受到免疫攻击时更易死亡。”