专栏名称: 生信人
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中介孟德尔纯靠肉搏拿9分,你累不累

生信人  · 公众号  · 生物  · 2025-03-19 07:00

正文

小编看到近期发的这样两篇文章,暴露都是肠道微生物,技术路线都是中介 MR ,可 IF 一个 3.9 ,一个 9.3 ,到底差在哪了呢?

研究一:

数据来源:

肠道微生物:从 MiBioGen 联盟收集了属级 GM 的汇总统计数据,包括 119 属;

非小细胞肺癌: NSCLC 数据来自芬兰数据库;

免疫细胞: 731 个免疫细胞。


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资料:2025年肿瘤相关研究方向与热点汇总


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工作流程:

首先研究了 GM NSCLC 的总体影响,免疫细胞特性对 NSCLC 的影响,双样本 MR 分析确定了对 NSCLC 至关重要的 GM 6 个属和 38 个免疫细胞性状;


然后研究了 6 属对 38 个免疫细胞性状的因果关系,进行双向 MR 分析,确定免疫细胞在 GM NSCLC 关联中的中介作用。


研究二:

数据来源:

肠道微生物:从 MiBioGen 联盟收集 211 个肠道微生物类群汇总统计数据,包括 131 属, 35 科, 20 目, 16 类, 9 门;

痴呆:多种痴呆类型, AD FTD VD PDD GWAS 汇总数据来源于芬兰数据库, DLB GWA 汇总数据来源于 IEU 数据库;

细胞因子: 41 种细胞因子。


工作流程:

首先研究了肠道菌群和细胞因子对 5 种痴呆类型的影响,然后将痴呆作为暴露,将与痴呆症相关的肠道微生物群或细胞因子作为结局,评估肠道微生物群、细胞因子和痴呆之间的双向因果关系;


最后研究痴呆相关的肠道菌群和与痴呆相关的细胞因子之间的因果效应,细胞因子在来自肠道菌群和痴呆的通路中不起中介作用。

对比来看两个研究,技术路线都是中介 MR 暴露都是肠道微生物,差就差在工作量 1 ): 研究二结局为 5 种痴呆类型,所以在第 ①② 步中就比研究一工作量大出 5 倍; 2 ): 两个研究都进行了双向 MR ,研究一在第 步中对与 C 有关的 A ,与







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