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零基础也能画出超酷信号通路图

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-05-02 18:01

正文


科研经验 | 文献 | 实验 | 工具 | SCI写作 | 国自然

作者:阳光 (转载请注:解螺旋·医生科研助手)

我们搞生物学及医学相关研究的,很多时候要做的就是研究某个分子的功能,而研究某个分子的功能当然有很多的方法,比如基因敲除等


当我们揭示了由于该分子的缺失所导致的表型之后,接下来要做的就是揭示其分子机制,说白了就是找到该分子发挥功能的信号通路的每一个分子,这样做出来肯定是一篇大文章了。


我们不是谈论细胞信号通路,而是给大家介绍一款画信号通路的神器。很多从事医学专业的朋友都需要写篇review,想画一个漂亮一点的细胞信号通路图,那可以试试 Pathway Builder Tool 这个专业的细胞信号通路画图软件。


接下来我们就简单的介绍一下该软件:


该软件构造很简单,主要由四部分组成:菜单,工具栏,画布以及面板



菜单与工具栏的作用主要就是添加文本,更改画布的背景以及保存制作好的信号通路图。


最主要的部分是面板,面板主要包括已经画好的信号通路的模板,甚至包括常见的,已经研究的比较透彻的信号通路图,还有一些细胞器,细胞膜,分子及受体模型。特别需要注意的是这些模型都是已经画好的,你直接利用即可,所以它的操作非常简单,很容易上手。


接下来就简单的介绍一下组成面板的各部分:


1. 各种信号通路模板图-------下图展示的是标准模板。



2. 常见的几种信号通路模板(包括AKT信号通路,p53信号通路以及JAK/STAT信号通路等)------下图展示的是AKT信号通路。



3. 细胞膜及各种细胞器模板------下图展示的是质膜,线粒体与核糖体。



4. 细胞表面受体及细胞内一些分子的模板 -----下图展示的是DNA,tRNA及G蛋白偶联受体。



5. 绘制信号通路图时要用到的各种箭头。



6.







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