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中医药研究又有新思路!“网络荟萃分析”和“网络药理学”两大王炸强强联手,成都中医药大学团队斩获一区Top,怎么做?

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-08-05 19:00

正文


大家好,又是元气满满的一天!馆长最近的工作超级多,几乎每天埋头苦干,差点就忘记和大家分享最新的生信进展啦,真怕大家忘记我呀!虽然馆长最近每天都要看大量的文献和书面材料,但有一篇文章就那么杀出重围,给馆长留下了深刻的印象,所以我决定必须要和大家分享一下!现在,就请大家跟着馆长我一起来看看这些亮眼的数据分析吧!
1. 首次将 荟萃分析 网络药理学 相结合,用于评价 不同剂量比的茵陈蒿汤( YCHD) 的治疗效果,并找到了具有最好疗效的最优组合。
2. 文章 突出了关键成分的活性和风险,强调了茵陈蒿的抗炎活性以及栀子和大黄可能导致的 肝损伤 风险,可以指导临床医生在使用 YCHD 时选择更安全和更有效的成分比例。
3. 本研究是传统与现代技术的融合。通过将 传统药物评价方法 现代药理学技术 结合,为 YCHD 的合理配方提供了科学依据。本文的方法也可以推广到其他中药方剂的研究,推动中药的现代化和个性化治疗。
4. 计划利用大数据分析和机器学习算法建立药物疗效和毒性预测模型,以更精确地指导临床用药,并为药物开发和设计提供新方法。 PS:如果你也 有各种有趣的想法,但苦于无从下手,可以来扫码联系馆长哦,馆长熟悉很多生信复现思路,更致力于深挖一切创新想法,发掘你在生信方向的潜力!

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题目:网络荟萃分析与网络药理学联合评价茵陈蒿汤治疗胆汁淤积性肝炎的优化治疗潜力
杂志:Phytomedicine
影响因子:IF=6.7
发表时间:2024年3月

公众号回复“666”即可领取原文献,文献编号240805


研究背景
胆汁淤积性肝炎被认为是肝纤维化和肝硬化发展的重要因素。茵陈蒿汤(YCHD)是治疗胆汁淤积型肝炎的著名经典方剂,在中国、日本、韩国等亚洲国家被广泛使用。然而,近年来有报道称,作为YCHD的主要成分,大黄(Rheum palmatum L.)和栀子花(栀子花)有肝损伤的风险。因此,问题出现了,对于治疗胆汁淤积性肝炎,YCHD是否仍然足够安全,或者是否应该采用最佳配比的成分。这些都是心理健康病学在临床应用中不可避免的问题
研究思路
本研究通过结合荟萃分析和网络药理学,系统评估茵陈蒿汤的安全性和疗效,并确定其最佳成分比例。首先,从多个权威数据库(如PubMed、Web of Science、EMBASE、Cochrane Library、中国知网、VIP和万方数据库)中检索相关试验数据,筛选符合标准的研究,并分析这些研究的疗效指标(如丙氨酸转氨酶ALT、天门冬氨酸转氨酶AST和总胆红素TBIL),使用STATA 16.0软件进行网络荟萃分析以评估不同成分比例的治疗效果。然后,基于网络药理学的方法,筛选与胆汁淤积性肝炎相关的疾病靶点和YCHD的活性成分靶点,利用Cytoscape 3.9.1软件进行靶点可视化分析,进一步解析YCHD的作用机制。
研究结果
1. 数据收集
最初检索到612篇研究,经排除后,最终纳入20篇符合条件的研究进行meta分析。
图1:文献筛选流程图
2. 抵消风险评估
利用 Cochrane 协作工具评估了20项纳入的研究。两项研究明确指出在随机化过程中使用了“随机数字表”,并被评为“低风险”。其余 18 项研究仅提到“随机化”,而未指定方法,因此被评为“风险不明确”。
图2. 对纳入研究的风险评估
3. 排序概率结果
在纳入的文献中,YCHD 的剂量比例存在明显差异,因此将所有临床对照试验按照茵陈、栀子和大黄的剂量比例不同分为六组,例如治疗组a(TG-a)为常规疗法(CT);治疗组b(TG-b)为YCHD 1 的类似配方(茵陈:栀子:大黄=2:1:1)+CT等。计算了与每个方案的疗效,得出结论,TG-a 是疗效最差的治疗方案,而 TG-d 成为最有效治疗方案的概率最高。
图3. 所有治疗组在不同可能排序下的排序概率结果

4. SUCRA
SUCRA,即累积排序曲线下面积,是网络荟萃分析中比较干预措施效果的重要方法。SUCRA值越大,表明治疗方案的效果越好。对于ALT,治疗效果从大到小排序为:TG-d(75.7 %)>TG-c(75.4 %)>TG-e(69.3 %)>TG-f(55.8 %)>TG-b(19.0 %)> G-a(4.9 %)。
图4. SUCRA的结果
5. 网络荟萃分析
图五为网络荟萃分析结果比较。(A)疗效;(B)ALT;(C)AST;(D)TBIL。结果显示,TG-a 的有效性不如 TG-b至TG-f,表明非常规方案的疗效显著提高。
图5. 网络荟萃分析结果比较
6. 成分-靶点-疾病关系网络及PPI网络图
将获得的胆汁淤积性肝炎靶点与茵陈、大黄、栀子和YCHD的相关靶点绘制在维恩图上,以获得共同靶点,例如茵陈和胆汁淤积性肝炎有72个共同靶点。使用Cytoscape 3.9.1软件鉴定出YCHD中度值较高的成分,再根据基因值,选择了最热门的靶点。将YCHD与胆汁淤积性肝炎的共同靶点导入String Protein Interaction Network数据库,构建了“人类”的PPI网络模型。
图6. 成分-靶点-疾病关系网络及PPI网络图
7. 胆汁淤积性肝炎的GO生物分析和KEGG富集分析
YCHD和胆汁淤积性肝炎之间的共同靶点被用作在 Metascape数据库中进行GO分析和KEGG富集分析的输入。其中,KEGG共鉴定出257条通路,包括脂质和动脉粥样硬化、胆汁分泌、类固醇激素生物合成、癌症中的转录失调、肾素-血管紧张素系统、钙信号通路等。
图7. 胆汁淤积性肝炎的GO生物分析和KEGG富集分析
文章小结
本研究采用荟萃分析与网络药理学相结合的新方法评价YCHD不同剂量配比的治疗效果,并将传统药物评价方法与现代药理学技术相结合,为YCHD的合理配制提供科学依据。同时,研究强调了茵陈的抗炎作用以及栀子和大黄的肝损伤风险,为YCHD的最佳剂量配比提供新的见解。这些发现可以指导临床医生在使用YCHD时选择更安全有效的成分配比,降低患者肝损伤风险,提高治疗效果。 虽然该研究仅进行了定性分析,但随着人工智能的发展,可以利用大数据分析和机器学习算法,通过综合分析临床试验数据、生物信息和药代动力学,建立药物疗效和毒性的预测模型,识别不同剂量和组合的药物疗效和毒性特征,从而帮助确定最佳药物配比。 屏幕前的你是不是就有相关经验或思路?如果希望能高效复现甚至超越上述研究,快来联系馆长~ 对于这种研究热点,晚了一步就少了一个机会呦!

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