我们知道10年前DNA修饰很火,5年前RNA修饰很火,现在蛋白修饰很火,当然现在还有很多这些主题的研究发表在主刊和领域TOP期刊上,每年国自然项目也有很多(就不列举了)。
不管是DNA、RNA还是蛋白修饰,大家比较熟悉的套路是“修饰酶-调控因子-功能分子-细胞表型”:
比如RNA m6A修饰酶METTL3高表达后促进转录因子FOXA1 mRNA m6A甲基化水平增加,从而提高FOXA1 mRNA的稳定性导致FOXA1表达增加,然后FOXA1转录激活BNIP3,最终促进线粒体自噬导致耐药。
比如糖酵解关键酶HK2高表达,导致乳酸产生增加,然后促进组蛋白(或者非组蛋白)的乳酸化修饰水平增加,进而促进FUNDC1转录(或者直接对FUNDC1蛋白进行乳酸化修饰),最终促进线粒体自噬导致耐药。
这样的例子还能举出来很多很多,各种组合+实验数据支持都能讲一个不错的故事,如果图漂亮一些,应该能试试中科院一区的期刊,大家也能看到很多这样的文章和基金案例。
虽然大家都这么做发文章报项目,个人还是有几个问题一直没有想明白,提出来与大家讨论。
我们说蛋白的乳酸化修饰很火吧,但是有两个问题:
1. 乳酸是机体正常生理过程的代谢产物啊(其它类似的代谢产物还有很多),确实乳酸能导致组蛋白(和非组蛋白)修饰并调控下游机制转录,那怎么干预呢?像运动、饮食等都能影响乳酸(或者其它代谢物)水平,影响因素不会太多了吗?而且乳酸代谢也是动态的,又复杂了好多……
2. 关于靶向工具分子设计药物的问题:我们知道METTL3这些修饰酶(或者糖酵解的酶HK2等,以及AARS1等)、E3泛素酶、转录因子等“工具分子”下游的分子是很多的(一对多的关系),比如METTL3既可以促进FOXA1 mRNA m6A甲基化,也可以促进另外一个完全不相关、甚至对细胞生存很重要的必需基因(Essential
gene)的m6A甲基化;而且一般来说,METTL3这种“工具分子”在细胞里面表达都不低,再加上修饰位点也不只是一个: mRNA的CDS区一个、3’UTR区一个,那靶向METTL3或者工具分子的抑制剂的副作用能有多大啊……
如果这么考虑的话,研究除了增加对疾病的理解外,那转化意义怎么说呢?请高人指点。