视频讲演 | 地表最强 GFF3/GTF 文件操作 ~ TBtools

生信石头 · 公众号 · 视频 · 2024-08-20 00:00

主要观点总结

本文介绍了如何使用TBtools的GFF3/GTF文件操作菜单下的12个功能，包括GFF3/GTF文件的各种操作如序列提取、信息提取、重新构建、特征寻回等。这些功能覆盖了基因结构注释信息文件的几乎所有常见操作。文章还介绍了该软件的界面化操作、本地化软件优势以及跨平台使用等特点。

关键观点总结

关键观点1: TBtools的GFF3/GTF操作功能介绍

文章详细列举了GFF3/GTF文件操作的12个功能，包括序列提取、信息提取、重新构建、特征寻回等，并且介绍了这些功能在基因结构注释信息文件操作中的应用。

关键观点2: 软件操作特点

文章强调了TBtools的界面化操作优势，无需掌握或者记忆命令，同时是一款本地化软件，无需注册，一次掌握，终生可用。

关键观点3: 软件兼容性

文章提到TBtools是跨平台软件，可在Windows、Mac OS、Linux等系统上使用。

正文

资源链接

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使用两个小时，完全介绍 TBtools 的 GFF3/GTF 文件操作菜单下 12 个功能的具体使用。

功能简介

GFF3/GTF Manipulate 覆盖了几乎所有常见的基因结构注释信息文件操作功能：

1.GXF序列提取（如CDS，启动子） 2.GXF信息提取（如基因位置） 3.基于序列的GXF重新构建（矫正） 4.GXF mRNA 特征寻回 5.GXF ID 前缀增加 6.GXF 代表性转录本 ID 一键获取 7.GXF 代表性转录本全注释文件获取 8.GXF 区域截取 9.基于 ID 的 GXF 特征获取 10.GXF 文件修复（推荐~） 11.GXF 文件信息统计（外显子数目等） 12.基因密度统计

功能优势

1. 界面化，无需掌握或者记忆命令 2. 本地化软件，无需注册，一次掌握，终生可用 3. 跨平台，Windows，Mac OS，Linux 等均可使用