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国自然方向|与“DNA损伤修复”、“免疫治疗”和“基因表达调控”相关的一个新方向

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-03-22 12:00

正文

国自然中 探索核心分子机制的 4 点思考逻辑 :

1.基因A表达的 时间和空间特征
2.基因A与 疾病风险因素的关系
3.基因A的 下游作用机制是什么

4.基因A 表达差异的原因是什么

最后介绍调控 RNA 表达异常的原因时列了 10 几个角度,今天我们就来介绍其中一个 R Loop DNA RNA 异源三聚体结构)

  1. 1. 首先我们看一下 R loop 是什么?

R-loop 是指在某些基因转录形成 mRNA 分子时,新合成的 RNA 链与模板 DNA 链互补配对,形成的 DNA:RNA 杂合双链与非模板 DNA 链一起构成的特殊三链核酸结构 R-loop 广泛存在于基因组中, 并富集在转录活跃的基因上 在哺乳动物基因组上约有 5% 的区域会形成 R-loop ,多数集中在转录起始区域和转录终止区域

  1. 2. 接下来我们看 R loop 方向的国自然等项目:

SWI/SNF 复合体抑制 R-Loop 诱导的 DNA 损伤及对耐药肿瘤靶向治疗的应用

剪接因子 SNRPA1 通过调节 R-loop 稳态影响肺腺癌发展进程的机制研究

PCNA/DHX9/ R-loop 轴增强奥沙利铂诱导胃癌免疫原性细胞死亡的分子机制研究

PRPF31 缺乏引起 RPE R-loop 积累导致视网膜色素病变的机制研究

ILF3 通过调控端粒 R-loop 影响端粒维持和细胞衰老的功能和机制研究

表观遗传修饰结构 R-loop 通过募集 PRC2 调控小鼠神经干细胞增殖分化的作用及机制研究

RNase H1 介导的 R-loop 清除在卵子成熟和母源 - 合子过渡过程中的生理功能及病理影响

PI3K/AKT/mTOR 信号通路介导 DNA RNA 异源三聚体( R-LOOP 促进乳腺癌内分泌治疗耐药的分子机制研究

异常染色质三维结构激活的 长非编码 RNA RP11-436D23.1 通过 R-loop 调控线粒体稳态在 NAFLD 发生和发展中的作用与机制

RNA m6A 调控 R-loop 结构稳态作用机制研究

R-loop 介导的 tRNA 基因表达和蛋白质翻译的分子机制研究


  1. 3. R loop 哪些细胞和分子过程有关?

1 )转录启动 / 终止过程和基因表达 R-loop 调控转录的启动和终止过程中起作用 ,影响 RNA 聚合酶的活性和转录效率。 R-loop 调控基因表达 中发挥作用,其在转录活跃的基因区域富集。

2 DNA 复制和细胞周期 R-loop 的形成和释放与细胞周期的调控和 DNA 复制过程 有关, 特别是在 S 期(合成期),转录和复制共享相同的 DNA 模板链,导致 R-loop 的形成。
3 )转录 - 复制冲突( Transcription-replication conflicts, TRCs R-loop 的形成与转录和复制机器在 DNA 模板上的冲突有关 ,这种冲突可能导致复制叉的停滞和基因组完整性的损害。

4 DNA 损伤修复和基因组稳定性 R-loop 的形成可能导致 DNA 损伤, R-loop 的异常积累可能导致基因组不稳定 ,与神经系统疾病和癌症等疾病的发生发展有关。






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