“蛋白翻译后修饰”可以比肩“细胞的十八种花式死亡”,真是类型繁多呀!除了之前介绍的“乳酸化、棕榈酰化”等外,借着中南大学团队
3.11
刚发表的
Nature Genetics
(
IF=31.7
),生信塔今天再推荐一个“琥珀酰化”,让粉丝们走在创新的第一线!(想更深入了解琥珀酰化的朋友,表格里涉及的文章也去细细品味吧
~
)
在这篇文章里,作者整合了空间转录组、蛋白质组和代谢组学分析,揭示了黑色素瘤中代谢物琥珀酰辅酶
A
与肿瘤免疫的关系,以及其对
PD-1
疗法效果的影响。作者鉴定出
PD-L1
的琥珀酰化修饰位点,并发现
CPT1A
是调控
PD-L1
稳定性的关键酶。研究设计思路巧妙,结合了临床样本分析、细胞实验和动物模型,具有较高的发表价值和科研创新性
作为生信账号,今天分享的这篇文献虽然有结合机制实验,但是创新靶点还是源自于多组学数据,毕竟是
IF31.7
的顶刊。
小伙伴们可以根据需要拆分一下,如果想发纯分析,可以只做到前面的多组学整合即可,依然可以发到好期刊。琥珀酰化不像其他类型的蛋白翻译后修饰机制那么老生常谈,属于相对小众的主题,创新性依然可以保持!目前来看发文一篇蓝海,如果你有兴趣的话可以戳戳下方找生信塔帮你定制相关思路
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杂志:
Nature Genetics
发表时间:
202
5
年
3
月
研究背景
本研究通过整合空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,揭示了琥珀酰辅酶
A
(
succinyl-CoA
)与黑色素瘤患者的抗肿瘤免疫反应及抗
PD-1
治疗疗效之间的强关联,为肿瘤免疫治疗提供了新的视角。
研究概要
(1)
多组学分析揭示代谢与免疫关系
通过整合空间转录组、蛋白质组和代谢组学技术,对接受免疫治疗的黑色素瘤患者样本进行分析。发现琥珀酰辅酶
A
(
succinyl-CoA
)水平与免疫反应及
PD-1
疗法效果密切相关。进一步鉴定出高水平
OGDH
、
SCS
和
SDH
的患者对免疫治疗有更好的响应,提示这些代谢酶可能作为潜在的生物标志物。
(2)
机制探究:琥珀酰化调控
PD-L1
稳定性
深入探究琥珀酰
-CoA
如何影响
PD-L1
稳定性。研究发现,
PD-L1
在特定条件下会发生琥珀酰化修饰,这一修饰导致其降解。
CPT1A
被鉴定为
PD-L1
的琥珀基转移酶,其活性直接影响
PD-L1
的稳定性。通过
体内外实验
,验证了
CPT1A
在调控
PD-L1
水平和肿瘤免疫反应中的关键作用。
(3)
临床验证与治疗策略优化
利用多个独立队列的临床样本,验证了
CPT1A
和
PD-L1
表达水平与患者预后及免疫治疗响应之间的关系。发现低
CPT1A
和高
PD-L1
表达的患者对
PD-1
疗法有更好的响应。进一步探索了
CPT1A
作为治疗靶点的潜力,发现激活
CPT1A
可增强抗肿瘤免疫反应,为开发新的免疫治疗策略提供了理论依据。
结论:
琥珀酰辅酶
A
通过调节
PD-L1
的稳定性影响抗肿瘤免疫反应,
CPT1A
作为琥珀酰转移酶在这一过程中发挥关键作用。
研究
主要
结果