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nvidia-docker2 在 Kubernetes 上实践

HULK一线技术杂谈 · 公众号 · · 2018-11-29 18:00

正文

女主宣言

nvida-docker2 可以帮助我们将旧的加速计算应用程序容器化，将特定的 GPU 资源分配给容器，并可以轻松地跨不同的环境共享应用程序、协同工作和测试应用程序。今天带来的分享是有关 nvidia-docker2 在大规模 Kubernetes 集群上的实践记录。本文首发于 OpsDev.cn ，转载已获取作者授权。

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The Dunes in Mars' Wirtz Crater

by NASA IOTD

现在公司线上所有的k8s集群对GPU资源的使用都是nvidia-docker 1.0(历史遗留问题)。但是现在的kubernetes1.9推荐使用device plugin的方式来对接外部厂商的资源。这样所有的厂商资源就不要kubernetes去特定的支持，而是各服务厂商只要按照kubernetes提供的device plugin实现自己的一套就可以了。今天就针对nvidia-docker2.0 进行了下测试。在此做下记录。

实验环境

CentOS Linux release 7.2.1511 (Core)
kuberntes: 1.9
GPU: nvidia-tesla-k80

Installation (version 2.0)

直接参照官方的安装教程: Installation (version 2.0))

https://github.com/nvidia/nvidia-docker/wiki/Installation-(version-2.0)

在安装nvidia-docker 2.0需要做一些准备的工作,要求如下:

GNU/Linux x86_64 with kernel version > 3.10
Docker >= 1.12
NVIDIA GPU with Architecture > Fermi (2.1)
NVIDIA drivers~= 361.93 (untested on older versions)

Your driver version might limit your CUDA capabilities

(see CUDA requirements )

https://github.com/nvidia/nvidia-docker/wiki/CUDA#requirements

简单的描述下安装的过程:

CentOS 7 (docker-ce), RHEL 7.4/7.5 (docker-ce), Amazon Linux 1/2

# If you have nvidia-docker 1.0 installed: we need to remove it and all existing GPU containers

docker volume ls -q -f driver=nvidia-docker | xargs -r -I{} -n1 docker ps -q -a -f volume={} | xargs -r docker rm -f

sudo yum remove nvidia-docker

# Add the package repositories

distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)

curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.repo | \

sudo tee /etc/yum.repos.d/nvidia-docker.repo

# Install nvidia-docker2 and reload the Docker daemon configuration

sudo yum install -y nvidia-docker2

sudo pkill -SIGHUP dockerd

# Test nvidia-smi with the latest official CUDA image

docker run --runtime=nvidia --rm nvidia/cuda:9.0-base nvidia-smi

nvidia-docker 2.0安装完成之后，需要配置docker的runtime为nvidia-container-runtime。

具体的内容如下:

{

"default-runtime":"nvidia",

"runtimes": {

"nvidia": {

"path": "/usr/bin/nvidia-container-runtime",

"runtimeArgs": []

}

重新启动docker服务:

systemctl restart docker

注意： If you have a custom /etc/docker/daemon.json, the nvidia-docker2 package might override it.

GPU on kubernetes

简述的描述下现在kubernetes对GPU的支持情况。kubernetes在1.6版本就开始对nvidia GPU的支持，并且仍然在不断的优化改进中。kubernetes对AMD GPU的支持是在1.9版本才支持。但是现在kubernetes仍然还没有支持多容器使用同一块GPU卡的情况。这样就会造成GPU资源的浪费。

kubernetes 官方文档描述:

Each container can request one or more GPUs. It is not possible to request a fraction of a GPU.

nvidia-docker2.0 已经安装完成了，继续，下来就是如何在kubernetes上使用了。kubernetes要调度GPU 有这么几点要求:

开启kubernetes对GPU的支持。(在1.10之前需要指定--feature-gates="DevicePlugins=true"。1.10之后就不需要在指定了)。
在kubernetes计算节点安装GPU drivers及device plugin。

对Device Plugins进行下简单的描述:

从kuberntes 1.8版本开始提供一套device plugin framework来为服务厂商接入它们自己的资源(GPUs, High-performance NICs, FPGAs)。而不需要更改kubernetes的源码。

现在我们只关心Nvidia-GPU，让我们来部署GPU device plugin, 具体的部署流程如下:

nvidia-docker-plugin.yml

apiVersion: extensions/v1beta1

kind: DaemonSet

metadata:

namespace: kube-system

spec:

template:

metadata:

# Mark this pod as a critical add-on; when enabled, the critical add-on scheduler

# reserves resources for critical add-on pods so that they can be rescheduled after

# a failure. This annotation works in tandem with the toleration below.

annotations:

scheduler.alpha.kubernetes.io/critical-pod: ""

labels:

spec:

tolerations:

# Allow this pod to be rescheduled while the node is in "critical add-ons only" mode.

# This, along with the annotation above marks this pod as a critical add-on.

- key: CriticalAddonsOnly

operator: Exists

containers:

- image: nvidia/k8s-device-plugin:1.9

securityContext:

allowPrivilegeEscalation: false

capabilities:

drop: ["ALL"]

volumeMounts:

- name: device-plugin

mountPath: /var/lib/kubelet/device-plugins

volumes:

- name: device-plugin

hostPath:

path: /var/lib/kubelet/device-plugins

创建GPU-device-plugin资源:

kubectl create -f nvidia-docker-plugin.yml

创建成功之后，在每台GPU机器上会有nvidia-device-plugin-daemonset的资源。

现在所有的准备工作都完成了。让我们来测试GPU能否正常的调度到GPU机器上吧。测试的gpu-pod资源mainfest内容如下:

nvidia-docker2-gpu-pod.yml

apiVersion: v1

kind: Pod

metadata:

spec:

restartPolicy: OnFailure

containers:

- name: cuda-vector-add

image: "k8s.gcr.io/cuda-vector-add:v0.1"

resources:

limits:

nvidia-docker2 在 Kubernetes 上实践

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