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致「开发生物软件」的朋友们,共勉吧。

生信石头  · 公众号  ·  · 2025-03-07 23:52

正文

昨夜,大力支持我开展「生物软件开发」工作的朋友给我电话大体提到了共同担忧。当然,他本身也在做「生物软件开发」。我现在几乎不说「生信软件开发」或者「生物信息学软件开发」?原因在早前推送提及,不做赘述。

不过,我觉得有一个非常简单的区分两类软件的的方法,那就是 「软件的目标用户」

我觉得这是一个非常重要的问题。因为每个软件都会有他的目标用户,只是有很多开发软件的或许并没有想清楚这个问题。

而在我们做具体评价的时候,说得直接一点:


  1. 「生信软件」 :如果你开发的软件是给「生物信息学」或者是「信息学」或者是「计算」甚至是「数学」等背景的研究人员使用的时候,那么祝贺你,大概率你的软件是会得到认可的。因为什么?因为你在其实是在给自己开发软件。你站在了圈子里,成果也完全可以得到认可;
  2. 「生物软件」 :如果你开发的软件是给「生物学」或者是「植物学」或者是「园艺学」等背景的研究人员使用的时候,那么也要祝贺你,因为你的软件其实大概率也会得到认可。但是非常遗憾,其实大多数时候,你并不是在给生信人员开发软件,你很可能会找不到圈子。个中体会,知者自知。


一字之差,区别甚大。但现实问题是什么?我斗胆说一句,现实问题就是:我们有很多很多优秀的生信软件,但是我们只有极少的优秀的生物软件,而国产生物软件更是鲜见。事实上,国产不国产,我们并不做强调。我想表达的是, 「我们最大的问题是什么?是没有发现自己有问题。」或者是「我们最大的错是什么?是不知道我们错了」 。如果不是 GPT 做起来了,我们会相信 LLM 这条路能走通吗?明显每个人都不信。人世间最大的悲哀,就是「明明我做好了一切,而你却选择了不相信」。

没有优秀的生物软件,会怎么样吗?不会怎么样。正如没有大语言模型,会怎么样吗?也不会怎么样?

所以到底是怎么样?很简单,那就是总有一天,当别人已经开上汽车的时候,你还不知道有自行车这回事。







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