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我科学家成功研发作物智慧育种新算法

科普中国  · 公众号  · 科学  · 2025-03-10 10:30

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近日, 中国农业科学院作物科学研究所 作物智能设计算法模型创新研究组成功研发一套新的人工智能算法——自动化机器学习框架, 通过将农作物的气象环境大数据与基因组信息深度融合,实现了作物精准遗传分析与基因组预测,为作物智能设计育种提供了有效工具。 相关研究成果发表在学术期刊《先进科学》上。


据研究组负责人介绍,粮食等农作物的高矮、茎秆粗细、节间长短和产量高低等特征都属于作物的田间表型,由作物的基因型、环境以及基因型与环境的互相作用共同决定。在实际育种过程中,准确预测作物的田间表型对于提高育种效率、缩短育种周期至关重要。然而,传统的基因组预测方法往往忽略了环境因素对田间表型的影响,导致在不同的环境条件下,对作物的田间表型预测精度常常有限。因此,将环境数据纳入基因组预测模型,考虑基因型与环境的相互作用,成为提升作物田间表型预测精度的关键。


研究团队基于大规模多环境下玉米杂交种的数据集,利用人工智能技术开发了一套自动化机器学习框架,将环境数据与基因组信息深度融合,开展遗传分析与基因组预测。比较传统基因组预测方法,该算法有三大亮点:一是集成遗传和环境特征处理功能;二是集成多种先进技术进行模型训练,提升模型训练效率和预测精度,与传统统计模型相比,计算时间可缩短290倍,且能保持较高的预测精度;三是利用独特的SHAP可解释技术解释模型,量化遗传和环境特征对作物表型变异的贡献。


研究组负责人表示,该研究可为解析基因型与环境互作的生物学机制提供重要参考,同时为作物育种提供新的工具。


策划制作

来源丨光明日报

责编丨钟艳平

审校丨徐来 林林








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