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刚刚!DeepSeek联合Zotero、Mermaid等工具出手了!急着发SCI的这下有救了!

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2025-03-17 18:50

正文

最近DeepSeek大火,不少医学党真的把它玩出了花。
DeepSeek+Zotero

文献阅读王炸组合: 成功配置后 ,它们能够让文献阅读变得方便高效,例如总结文献主要内容、润色语言、文章翻译等。

DeepSeek + Mermaid

科研绘图王炸组合: 配合使用,我们可以快速生成结构化流程图,并借助工具如draw.io等绘图工具将其渲染为高质量的可视化图表。

DeepSeek+医学知识库

专为医学党打造的科研王炸工具: 要知道,用DeepSeek最大的担心就是“AI幻觉”,有时会胡编内容,推荐一些不存在的文献,给很多科研人员带来困扰。

为此,我们就想如果能够 在DeepSeek的基础上接入了专业严谨的医学知识库, 那么这个问题不就可以了迎刃而解了么?

接下来,小编就来为大家介绍一个 「DeepSeek+医学知识库」的王炸工具—— 「DeepSeek满血科研版」

  • 它可以提供 更加深入、更加精准 的回答。

  • 它能解决DeepSeek容易产生 “AI幻觉” 的问题。

  • 它默认是 “深度思考” 模式,直接输入问题,点击发送即可。

  • 而且,它真的一点都不卡!

现在扫码即可报名课程,看课 免费 体验工具~

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DeepSeek+仙桃学术

光速发文组合: 从读文献、写作到绘图,全都轻松搞定!

要知道,学生时期还能靠时间读读文献攒攒数据,主治阶段只能靠命做科研了!平时临床工作钱少事儿多不说,主任还疯狂push我写sci申课题,达不到要求就得下放?这是什么苦命人!

幸好,我发现了这个光速发文组合—— DeepSeek+仙桃学术!

接下来,跟着小编一起看看如何运用这两个工具轻松复现 这篇 诊断模型的二区Top 6+SCI ,实现光速发文梦!


期刊:Journal of Translational Medicine(IF=6.1)

发布时间:2025/01/02

作者通过整合单细胞测序和机器学习技术,深入解析了肺纤维化的细胞和分子机制,并开发了一个新的诊断模型,为肺纤维化的精准医疗提供了新的视角和工具。

别看这篇文章使用了 单细胞+机器学习 的分析,你就觉得 硬件要求、代码能力门槛高,不敢上手做复现。

随着各类科研工具的增加,以前咱们觉得特别高大上的分析,纷纷都更好上手了。

接下来,小编就带大家尝试使用各种工具,去攻克复现过程中可能会遇到的疑难杂症→ 查数据、分析数据、绘制图表, 轻松拿下~


0基础查数据?

一键获取GEO/TCGA等数据库信息!

通过对本篇文章的详细拆解,我们可以发现:

作者从GEO数据库中收集了GSE110147、GSE213001、GSE136831和GSE150910等数据集,为肺纤维化的研究提供了基因表达数据。

要知道,GEO数据中的数据多是收录全球研究者的高通量基因组数据,包括微阵列芯片和二代测序数据,数据公开且免费。

在使用前,必须要对其进行 数据清洗 从学习到实操,整个过程复杂且极易出错!

数据清洗一般包括样本筛选(剔除低质量或不符合条件的样本)、ID转换(将探针ID转为基因符号)、表达矩阵标准化(如limma的normalizeBetweenArrays函数),以及注释纠错(手动核对样本信息)。

为了帮大家节省下数据清洗的时间成本,仙桃学术云端数据库 由原来的TCGA数据库的33种疾病扩张到GEO数据集, 清洗数据量增加一倍,非肿瘤也可一键出图!

骨关节炎,骨质疏松,急性肺损伤,急性心肌梗死,肺纤维化,冠心病,类风湿性关节炎,帕金森,脑卒中,糖尿病,心肌纤维化,炎症性肠病,银屑病,抑郁症,子宫内膜异位症……

我们以 “GEO” 为检索词,在仙桃学术平台进行简单搜索,结果如下↓

数据集名称、样本数、物种、类型、平台号, 都一一展示清楚了。

以上相关疾病领域的同学速来用仙桃学术一键获取预清洗后的数据,快速发表你的3+分SCI文章!


0基础做数据分析?

仅需点点点,轻松搞定差异分析、功能聚类分析……

在本篇文章中,作者整合了多种分析方法和策略,用以验证和提升研究的可信度。

有:差异表达基因(DEGs)分析、功能富集分析、构建肺纤维化诊断模型、诊断模型的验证、免疫细胞浸润分析、亚型识别和免疫浸润差异分析、关键基因的功能验证(Western blot和动物模型实验)……

但对于小白来说,光是理解数据分析方法就已经很难了,如何能快速上手进行数据分析呢?

推荐使用 【仙桃学术】平台







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