图中显示了细胞内所有流感病毒基因组RNA
当一株流感病毒与另一株病毒混合进入（co-mingles）一个细胞内时，“漏洞”使病毒能够交换遗传物质，从而创造一株新流感病毒。了解这些漏洞和它们之间的相互作用有助于流行病的更好预测和破坏流感病毒的新方法开发。
文章通讯作者、微生物学和分子遗传学助理教授Seema S. Lakdawala
博士说：“千百年来流感一直困扰着公共健康，然而这么多年过去了，我们却对流感知之甚少，这项发现能帮助解答流感病毒的进化问题，为更好的疫苗和抗病毒药物开发助力。”
导致流感（influenza）的流感病毒（flu
virus）是一种单链RNA型病毒，由8个RNA片段和保护性核蛋白组成。所有RNA片段必须都聚集在病毒颗粒内才能完全感染。
流感病毒的经典模型有点串珠。核衣壳蛋白质将RNA均匀地排列在一根“绳”上。
注意模型中间的“串珠”
1970s该模型（RNA
loops）开发时所用的技术存在局限性，使该模型缺乏独特性。因此教科书中对流感的普遍描述是：每个RNA片段整段都结合着均匀且随机分布的蛋白质。
Lakdawala致力于病毒的出现和传播研究，他与专攻RNA相互作用的微生物学和分子遗传学系助理教授Nara
Lee博士实验组联手，想要了解流感RNA链上是否存在某些更加“开放”的区域，这样就可以与其他RNA片段关联，方便8片段打包。
于是他们使用了“高通量RNA测序和交联免疫（HITS-CLIP）”技术手段，测试了包括2009 甲型H1N1流感病毒在内的两种甲型流感病毒株。
“老实说，我们开始并不指望真的能发现我们所预期的‘裸露’的、缺少蛋白质结合的RNA区域，因为教科书里确切描写了‘病毒RNA串珠’结构，”Lakdawala说。“但是令人惊讶的是利用最新科技我们发现有几片RNA并没有与核蛋白结合。这一发现开辟了一个全新的研究领域！”
与传统模型相反，Lakdawala和Lee发现RNA有些地方富含蛋白质衣壳，有些部分却是裸露的，且更容易与其他病毒RNA结合或与其他流感病毒交换基因组材料。
上方是“经典”模型，下方是本文揭示的新模型
匹兹堡大学进化生物学专家Vaughn Cooper博士指导研究小组探索了这一结构将如何塑造野生病毒在流感高发期的进化。
“许多研究都可以建立在这项新发现的基础上，包括预测不同流感病毒共享遗传物质制造新病毒的方法，预测下一次流感大流行类型，创建有针对性的疫苗等，”Lakdawala说。“此前大家都忽略了这个现象，认为50年前有关基因组结构的研究理所当然的正确，因为它可能看起来很容易解释，于是就接受了完整的故事。”
最新这项发现表明，如果我们不经常质疑和重新检测已有的科学教条，很可能就会与重大发现擦肩而过。
原文标题
Genome-wide analysis of influenza viral RNA and nucleoprotein association
