虽然近年来 lncRNA 的研究成为生物医学领域的大热门,陆续有新的 lncRNA 序列被报道,但是绝大多数 lncRNA 的功能和作用机制仍不清楚。
本课程将结合 CRISPR/Cas9 基因编辑技术与 lncRNA 两大研究热点,分析如何使用已建立的 CRISPR/Cas9 lncRNA library 寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的 lncRNA,以及如何进一步开展后续的 lncRNA 功能和作用机制研究。
本次课程将从背景介绍、研究思路、案例分析三个方面,系统、全面并深入浅出地介绍和分析 lncRNA 的研究策略,内容涵盖实验方案设计、研究手段运用以及具体案例分析及有关 lncRNA 研究必备实验方法的操作要点。
适合生物、医学领域的科研工作人员
莫寅元教授:
1956 年出生杭州,1982 年毕业于浙江大学。1991 年获美国华盛顿州立大学植物病理博士学位。1992~1994 年在美国华盛顿州了大学微生物博士后研究。
曾就职于孟菲斯 St. Jude 儿童研究医院、芝加哥伊利诺州大学。参与美国 CDMRP 项目,NIH 项目和我国国家自然项目评选。
现为密西西比大学医学中心癌症研究院药理、毒理学教授,癌症项目主要负责人。主要研究 mirRNA 和长非编码 RNA 在肿瘤发生、发展中的作用及药物的抵抗。
第一天
Discovery of lncRNAs
Characteristics of lncRNAs
Significance of lncRNAs
Classification of lncRNAs
LncRNA-mediated gene regulation
How to select lncRNAs of your interest
Database search (lncRNA targets; TCGA; and Lncipedia etc)
10:40~12:00 CRISPR/Cas9 basics
How CRISPR/Cas9 works
gRNA design (online programs)
sgRNA vs dual gRNAs
LncRNA KO, gene silencing and gene activation
Generation of KO or gene activation libraries
Rescue
Genome browser
14:00~15:20 Screening approaches
CRISPR/Cas9-based library screening
Direct screening
Reporter assisted screening
Types of reporters
Target validation
15:40~15:10 Examples of screening
15:10~16:00 Q&A,consultation for project design
第二天