7月暑假季，你准备好学习哪些内容为自己充电了吗？
主办单位： 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位：北京市计算中心
协办单位：云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训地点： 北京海淀区丰贤中路7号3号楼，北京市计算中心三层会议室
培训时间：2017年7月1日-3日 （报名中） 上午：9：30 - 12：00 下午：13：30 – 17：00
| 日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 表观遗传学概述 | 1. 表观遗传学概述
2. 表观遗传学相关数据库简介
3. 表观遗传学实验数据的分析方法 |
生物信息技术基础 | 1. 软件安装与调试
2. linux基础上机
3. perl语言基础
4. R语言基础 |
第二天 | DNA甲基化 | 1. DNA甲基化原理及应用
2. DNA甲基化测序方法介绍 |
DNA甲基化上机练习 | 1. MeDIP-Seq测序数据分析
2. RRBS-Seq测序数据分析 |
第三天 | 蛋白质与DNA相互作用研究 | 1. Chip-seq技术方法概述与应用
2. Chip-seq分析流程与实践 |
数据结果可视化展示与分析 | 1. 数据结果可视化展示
2. IPA数据分析与挖掘
3. 自由练习与讨论 |
（课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【讲师团队】
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
【报名费用】 注册费：3500元/人（资料费、上机费、午餐费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）
附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，费用自理。
【报名优惠政策】
1、6.15日前报名成功并缴费每人可优惠200元，老学员可再额外优惠200元；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额；
培训座位按收到报名表先后顺序安排。
培训时间：2017年7月5日-7日 （报名中）上午9：30-12：00，下午13：30-17：00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 概述 | 1.生物信息学数据处理概述； 2.Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围 |
运行调试 | 3.Perl语言解释器、编辑器安装； 4.Perl运行环境测试与程序编写； 5.UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理； 6.基于宏的perl语言快速编程 |
操作基础 | 7.Perl语言基本变量、操作符、判断结构；循环结构； 8.Perl语言常用函数的功能应用； 9.生物学数据文件的读入与输出； 10.生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等； 11.批量自动化数据文件操作 |
第二天 | 生物信息实例应用 | 12.常用生物信息学数据文件格式简介； 13.用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列； 14.用perl进行生物学数据文件格式转化； 15.用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息； 16.用perl批量自动化下载基因序列； 17.用perl进行DNA到protein批量翻译； 18.用perl批量DNA序列反向互补； |
高级数据处理 | 19.Perl语言的数组、二维数组、hash表用法； 20.用perl自动化从表格数据提取信息； 21.矩阵数据文件的生成与应用 22.二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用 |
第三天 | 模块与子程序 | 23.perl子程序与模块应用；
24.强大的正则表达式的应用； 25.用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计； |
Perl的高级应用 | 26.Perl第三方代码库CPAN的简介与应用； 27.Bioperl模块与应用； 28.常用生物信息学程序实例； 29.用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析； 30.基于perl的circos基因组作图工具介绍； |
（此表仅供参考，授课内容以实际授课为准）
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
1、对口生物信息； 2、非严格语法，适合初学；
3、功能强大、跨平台；4、有巨大的第三方代码库CPAN
【报名费用】 注册费：3000元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。
【报名优惠政策】
1、5.20日前报名缴费，可享受减免200元优惠；
2、3人以上团体报名每人可减少400元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
培训时间：2017年7月8日-11日（报名中） 上午9:30-12:00 下午13:30-17:00
日期 | 时间 | 课程名称 | 课程内容 | 备注 |
第一天 | 9：30-12:00 | 肿瘤精准医学概述 | 1.肿瘤基因组特点 2.肿瘤精准医学研究现状及挑战 | 理论 |
13:30-17:00
| 高性能计算平台介绍 | 1.高性能计算机概述； 2.Linux操作系统简介； 3.Linux命令与操作基础； | 上机 |
第二天 | 9:30-12:00 | 重测序技术在肿瘤研究中的应用 | 1.重测序技术理论介绍 2.重测序数据分析基本流程 | 理论+上机 |
13:30-17:00 | 1.肿瘤体细胞变异的鉴定及功能注释 2.肿瘤重要驱动基因的鉴定及案例分享 | 理论+上机 |
第三天 | 9:30-12:00 | 转录组测序技术在肿瘤研究中的应用 | 1.转录组测序理论介绍 2.转录组测序在肿瘤研究中的应用及案例分享 | 理论 |
13:30-17:00 | 1.基因表达量估计及差异表达基因分析 2.基因注释 | 上机 |
第四天 | 9:30-12:00 | 肿瘤研究中的统计分析 | 1.肿瘤样本生存分析方法与实践 2.基因组变异与临床数据关联分析 3.基因表达与临床数据关联分析 | 理论+上机 |
13:30-17:00
| 利用肿瘤生物信息数据库进行数据挖掘、文章发表案例 | 1.NCBI数据库介绍及应用 2.TCGA数据库介绍及应用 3.cosmic数据库介绍及应用 4.利用公共数据库发表文章案例解析 | 理论+上机 |
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】 注册费：4500元/人，包括学费、资料费、上机费。培训期间可免费提供午餐。
【报名优惠政策】
1、6.20前报名并缴费的学员每人可减少300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
培训时间： 2017年7月12日-14日 （报名中） 上午9：30-12:00,下午13:30-17:00.
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 科技论文绘图基础知识 | 1.科技论文图表要求与论文投稿中的图片格式修改、高分辨率原图处理、矢量图格式要求等； 2.绘图基础知识、图文件类型、来源与绘制方法介绍； 3.常规绘图与实现方法及软件学习； |
生物信息学常用工具及绘图方法 | 1.基于Photoshop的高清位图处理、工具使用与修图技术； 2.运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换； 3.学习Mega、BioEdit、WeGO、weblogo等常用生物学专业软件的图表及格式转换 4.利用Pymol蛋白质、核酸等大分子3D结构图制作； |
第二天
| R绘图基础 | 1.R语言简介 2.R语言基本功能及基本语法介绍 |
生物统计绘图及R语言实现基础 | 1.掌握R的绘图相关命令 2.学会绘制常见的图表（散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制） |
第三天 | 生物大分子相互作用及网络分析绘图 | 1.生物大分子相互作用与网络图基础知识； 2.基于String、DIP等数据库的蛋白质相互作用分析与图形可视化； 3.利用Cytoscape 绘制生物分子交互作用复杂网络图、生物学通路的方法及技术应用； |
矢量图修图基础与技术应用 | 1.矢量图处理工具Adobe Illustrator学习与功能应用； 2.学习使用Adobe Illustrator以及其他画图工具对绘制完毕的图片进行修改； 3.PDF文件处理与高清图片处理的快捷方法； 4.科研论文的组图要求与技术； |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】 注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。
【报名优惠政策】
1、6.20日报名并缴费优惠200元；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排
培训时间： 2017年7月19日-21日（报名中）本次课程时间： 上午：9:30-11:30下午：13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天
上午 | 微生物组学研究的发展和挑战 | 1.微生物组研究的发展历史 2.测序平台介绍 3.基于测序的研究方法 3.1 宏基因组（target sequencing 和全基因组） 3.2 单个微生物de novo测序 4.应用案例分析 |
第一天 下午 | target sequencing数据分析 | 1.linux常用命令使用和上机操作 2.数据分析过程中的编程简介（perl、R、python等） 3.target sequencing数据分析加上机 3.1质控 3.2去嵌合体 3.3 OTU聚类 3.4 注释 3.5统计分析：（1）α多样性分析；（2）β多样性分析；（3）群落结构及丰度分析；（4）进化分析；（5）差异分析(Lefse)；（6）功能分析(picrust)。 |
第二天 全天 | Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 | 1.质控 2.拼接组装：SOAPdenovo；MetaVelvet; Meta-IDBA等 3.聚类Binning：TETRA; MetaCluster; Phymm等 4.基因注释：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator等 5.功能注释：RAMMCAP；Blast等 6.统计分析：（1）物种分析；（2）功能分析；（3）差异分析；（4）表达分析 |
第三天 全天 | 微生物de novo测序分析 | 1.质控 2.单细胞测序去污染、去嵌合体等 3.拼接组装：SPAdes等 4.基因预测 5.功能注释 6.代谢途径分析 7.进化分析：（1）SNP；（2）插入缺失（3）水平基因转移； 8.转录组分析：（1）基因差异表达分析；（2）代谢通路分析 |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】 注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。
【报名优惠政策】
1、6.20日前预报名的学员每人可优惠300元，
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、 同时报2个以上培训班的可额外优惠200元
5、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
培训时间：2017年7月26日-27日（共2天）
开课时间 | 课程题目 | 课程内容 | 授课形式 |
第一天 | 上午 | 蛋白质组学数据分析 | 1.蛋白质组学的方法和进展 2.蛋白质组学数据解析流程及统计分析 3.蛋白质组学差异蛋白筛选、生物通路分析 4.多组学数据整合分析 | 理论+上机 |
下午 | 宏基因组学数据分析 | 5.宏基因组学研究现状及应用 6.宏基因组数据分析流程设计 7.常用数据库介绍 8.方案设计与案例分享 | 理论+上机
|
第二天 | 上午 | 基因组学数据分析 | 9.基因组学与生物信息学前沿 10.基因组测序分析介绍 11.基因组重测序/外显子组测序分析介绍 12.基因组测序策略及案例分享 | 理论+上机 |
下午 | 转录组学数据分析 | 13.转录组测序进展及热点介绍 14.转录组测序数据分析（有/无参考序列） 15转录组高级数据分析（聚类、网络构建等） | 理论+上机 |
培训特色：
一流的讲师团队--基因组学专家及一线分析人员亲自授课
全面的课程--技术应用、原理流程、遗传案例分析全贯穿
理论知识与上机操作相结合，为每位学员提供实际操作机会
增值服务， 课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答
小班教学，每期培训班的人数不超过35人。
【报名费用】
注册费：2500元/人，包括学费、资料费、上机费。培训期间可免费提供午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。
【报名优惠政策】
1、6.20日前报名并缴费优惠200元。
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
培训时间：2017年7月28-30日 上午9：30-12：00，下午13：30-17：30
日期
| 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 基因组关联分析理论基础 | 1.基因组学与生物信息学概述； 2.基于群体遗传的数据获取； 3.基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍； 4.常用GWAS数据库介绍； |
Plink软件基础应用 | 5.Plink软件应用； 6.Plink文件格式生成与解析； 7.等位基因频率计算； 8.哈-温平衡计算； 9.目标区域数据提取； 10.基因组关联分析流程； 11.关联分析结果分析与p校正； |
第二天 | 基因型填充Imputation | 12.基因型填充Imputation的原理及应用； 13.Beagle软件介绍与应用； 14.基因组填充的方法与分析流程； 15.1000G数据应用 |
Plink软件进阶应用 | 16.基于家系的关联分析； 17.曼哈顿图的绘制与结果展示； 18.SNP位点的condition分析； 19.Meta gwas数据分析； |
第三天 | Haploview软件 | 20.Haploview软件应用； 21.Haplotype单倍型分析； 22.LD连锁不平衡指数计算； 23.SNP marker之间的r2、D值等计算； |
Tassel软件 | 24.Tassel软件应用； 25.Tassel基于命令行的批量数据分析； 26.生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等； |
(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出，内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练，重实践，力求实效
小班授课，个别辅导
【报名费用】注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。
【报名优惠政策】
1、6.20日前报名并缴费，可享受减免300元优惠；
2、3人以上团体报名每人可减少400元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
付费方式： 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称：北京市计算中心
账 号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（备注：在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”）
