游离细胞DNA肿瘤分数及体细胞拷贝数变异与转移性三阴乳腺癌生存的相关性

Daniel G. Stover, Heather A. Parsons, Gavin Ha, Samuel S. Freeman, William T. Barry, Hao Guo, Atish D. Choudhury, Gregory Gydush, Sarah C. Reed, Justin Rhoades, Denisse Rotem, Melissa E. Hughes, Deborah A. Dillon, Ann H. Partridge, NikhilWagle, Ian E. Krop, Gad Getz, Todd R. Golub, J. Christopher Love, Eric P.Winer, Sara M. Tolaney, Nancy U. Lin, and Viktor A. Adalsteinsson

本刊负责人：马冬  广东省人民医院

审校：陆劲松  上海交通大学医学院附属仁济医院

翻译：蔡文杰 福建医科大学附属泉州第一医院

摘要

目的 ：游离细胞DNA（cfDNA）技术可以最小的创伤进行全基因组肿瘤基因改变的检测，结果可能与患者预后相关，无需再进行肿瘤的活检。三阴乳腺癌以少数突变和广泛体细胞拷贝数变异（SCNAs）为特征，然而转移性TNBC的SCNAs仍然知之甚少。我们尝试通过cfDNA评估转移性TNBC的SCNAs，并确定cfDNA中肿瘤分数是否与转移性TNBC的总生存相关。

患者与方法 ：在这项回顾性队列研究中，我们纳入了单个三级医疗机构中164例经活检证实为转移性TNBC的患者，并且接受过（新）辅助或转移方案化疗。我们对其血清cfDNA进行了低覆盖度的全基因组测序。

结果 ：在预先未知肿瘤突变的情况下，我们检测到了96.3％患者的cfDNA肿瘤分数和63.9％患者中存在SCNAs。在TNBC转移灶和原发灶中，拷贝数概况和基因组变异的百分比非常相似。与配对的原发肿瘤及公开获取的癌症基因组图谱和METABRIC数据库中的TNBC原发灶相比，TNBC转移灶的特定SCNAs频率更高，其中包括NOTCH2，AKT2和AKT3驱动子的染色体扩增。预先设定的cfDNA肿瘤分数阈值≥10％与转移生存率更差显著相关（中位数为6.4 V. 15.9个月），而且经临床病理因素调整后仍然是显著的独立影响因素（风险比，2.14； 95％CI，1.4-3.8； P <0.001）。

结论 ：据我们所知本文是专门从cfDNA检测转移性TNBC基因组特征的最大宗报导。在这个大宗转移性TNCB队列中，几乎所有患者均适合进行cfDNA肿瘤分数的评估，肿瘤分数≥10％与生存较差显著相关。特定的SCNAs在转移性TNBC中富集且与预后相关，对转移、耐药和新的治疗方法都具有意义。