相信大家都会遇到这样的问题，临床或科研上遇到一个大家系或者非常罕见的案例，需要诊断或研究时，但是家属或者课题经费不足，又想尽可能地分析得到候选致病位点，这时候如何选择样本测序就很有讲究了，所谓题目中的性价比就是尽可能多出成绩少花钱，游侠结合自己的经验谈谈这方面的想法，如有不足之处还请各位批评指正。
在选择哪些样本进行测序时要结合家系图来看，比如最常见的是下面只有一个孩子患病的一家三口。
游侠认为这种要分情况来讨论，对于临床来说，如果医生非常明确地根据表型判断出疾病名称并且相关基因不是非常多的情况下，推荐做先症者单人检测，如果医生对疾病不熟悉或者致病基因非常多的情况下（比如智力低下、癫痫等），推荐做一家三口全外显子，从生信分析角度来说，trio分析可以一定程度上减少对临床表型完整性的依赖，也许之前我不会这么建议，但考虑到最近全外显子价格已经下降很多，所以对于特别疑难的案例
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是推荐的。对于科研来说，建议先做先证者，如果排除已知的致病基因，再做父母的全外显子。
对于这种父母一方也患病的情况，如果是临床建议做先证者，对同样患病的父母一方进行测序虽然可以缩小候选位点范围，但价值不是非常大，看家属经济条件，对不患病的父母一方进行测序则完全没有必要。对于科研建议先做先证者，如果排除已知的致病基因，再做患病父母的全外显子，特别提醒，即使患者的父母DNA不测序也要同时采集，不然以后很难搞。
像上面这种兄妹俩同时患病的，从遗传模式看更可能是常染色体隐性遗传，当然也不能排除常染色体显性遗传以及线粒体遗传，建议先测其中一个患者，如果没有找到致病位点则对父母进行检测，另一患者可用一代测序验证候选位点。对于科研来说，在先证者检测后未发现致病位点的情况下则建议一家四口全外显子测序。
如果像上面这种，更像是显性遗传，有些人会建议测患者3，
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，
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寻找共同突变，但是这样筛选下来会仍然有很多候选位点，游侠建议测
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，
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，
3
因为寻找样本
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的新发突变是最简单与直接的，每个人新发突变在编码区平均下来只有不到
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个。
如果是显性遗传但已经收集不到第一代未患病的DNA，那么建议优先选择亲缘关系比较远的两个患病个体（如样本
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