现在国际上最具有影响力的微生物组研究项目有:Human Microbiome Project (HMP)，Metagenomics of Human Intestinal Tract (MetaHIT)，Earth Microbiome Project (EMP)
随着HMP,MetaHIT,EMP的开展，科学家们积累了越来越多微生物组学的研究经验，也使得更多科研工作者投入到该领域的研究中。在人体中，肠道微生物结构最为复杂，是人类微生物组研究的焦点。基于临床资料和文献报道，本文重点讨论开展肠道微生物组研究最重要的环节，即样本采集。
1.
样本筛选
1.1
基本信息
（1）年龄：在18到65岁
（2）饮食：1周内未食用酸奶
（3）人群：该地区常住人口
（4）非孕妇，哺乳期妇女
1.2
药物
两个月内无抗生素，益生菌、益生元、合生元，铋碱式水杨酸盐药物的使用；无药物及酒精滥用
1.3
疾病
（1）胃肠道疾病：无炎症性肠病(IBD)，肠易激综合症(IBS)，胃肠炎、结肠炎或胃炎，胃肠道出血、溃疡，胃肠道息肉或包块或发育不良，其他原因的慢性或持续性便秘或者腹泻
（2）慢性及代谢性疾病：无高血压，糖尿病，心血管疾病，糖尿病，肥胖，肝硬化，脂肪肝，癌症
（3）感染：无急慢性细菌、真菌、病毒感染
（4）手术：无较大的胃肠道手术
【参考：1，11-14】
2.
材料准备
表1：
耗材和仪器列表
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产品
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公司
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货号
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价格
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便盆
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Fisherbrand™ Commode Specimen Collection System
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Thermo
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02-544-208
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$216.09 / Case of 60
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采集管
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Faeces container 76x20mm
（
label, sterile
）
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Sarstedt
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80.734.311
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¥
4.4 / Case of 1
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分装管
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Glass Bead Tubes, 0.1mm
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QIAGEN
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13118-50
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$145 / Case of 50
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试剂盒
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DNeasy PowerLyzer PowerSoil Kit
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QIAGEN
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12855-50
或
12855-100
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$274 / Case of 50
或
$514 / Case of 100
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匀浆器
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PowerLyzer 24 Bench Top Bead-Based Homogenizer
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QIAGEN
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