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管轶等最新证据：走私穿山甲携冠状病毒，与新冠高度相似

科学网 · 公众号 · 科学 · 2020-02-20 16:32

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来源 | BioWorld

2月20日，香港大学公共卫生学院教授管轶和广西医科大学教授 胡艳玲 作为共同通讯作者在预印本网站 bioRxiv 发表题为：Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China 的最新研究论文。

研究团队对广西和广东反走私行动中查获的多个穿山甲样本进行检测，并在 穿山甲样本中发现了冠状病毒 ，属于此次新冠病毒的两个亚型，其中一个受体结合域与新冠病毒密切相关。

此次发现穿山甲冠状病毒的多个谱系及其与新冠病毒的相似性表明，穿山甲应被视为此次新型冠状病毒的可能中间宿主，再次强调应禁止在菜市场等交易穿山甲等野生动物。

这是继2月6日，华南农业大学宣布发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主后的又一力证。

2019年12月底，湖北武汉出现不明原因肺炎疫情，随后该疫情扩散到中国其他地区以及亚洲、欧洲、北美、非洲等20多个国家，后证实该肺炎疫情与一种新型冠状病毒有关，该冠状病毒当时被临时称为2019-nCoV，近日该病毒被命名为SARS-CoV-2。

此次新型冠状病毒导致的肺炎疫情暂时与武汉的华南海鲜市场有关，市场里销售的野生动物可能是传染源。

疫情发生初期，多名确诊病例与华南海鲜市场有关，因此市场很快被清理干净，但并未留取野生动物样本，因此无法从市场中调查野生动物的源病毒。

中科院武汉病毒所石正丽团队在Nature发表的论文显示， 中华菊头蝠是最有可能的此次新冠病毒的自然宿主 ，但尚未在其他其他野生动物中发现与之密切相关的冠状病毒，因此并不清楚将该病毒传播给人类的中间宿主到底是谁。

穿山甲，是被非法买卖最严重的哺乳动物，它们即被用作食物，又被用作中药材。因此，管轶团队从被走私的穿山甲中着手调查。

管轶团队收集了2017年8月至2018年1月期间广西海关在反走私行动中查获的18个冷冻穿山甲的（肺，肠，血液）等43个组织样品。

令人惊讶的是，高通量测序显示在43个样本中的六个（两个肺，两个肠，一个肺肠混合物，一个血液）存在冠状病毒。

接下来，研究团队对2018年5月至7月之间收集的另一批穿山甲样品进行了进一步的qPCR检测。发现12只穿山甲的19个样本（九个肠组织，十个肺组织）中，三个肺组织样本呈冠状病毒阳性。

然后，管轶团队联系了广州海关技术中心，中心重新检测了他们在三月份的反走私行动中查获的五份存档的穿山甲样品，这些样本中同样发现了冠状病毒。

这些在穿山甲中发现的冠状病毒的基因组， 与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组相似率在85.5％—92.4％ ，并在系统进化树中代表了新冠病毒的两个亚型，其中之一（GD/P1L和GD/P2S）与新冠病毒密切相关。

新型冠状病毒（SARS-CoV-2）属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属，先前已经注意到，Sarbecovirus亚属的冠状病毒成员经历了广泛的基因重组。

管轶团队进一步进行了重组分析，分析结果显示，蝠冠状病毒ZC45和ZCS21包含多个SARS-CoV相关谱系（基因组区域2、5、7）和新冠病毒相关谱系（包括此次穿山甲中发现的病毒谱系）的基因组片段（区域1、3、4、6、8）。

然而，更值得注意的是在穿山甲冠状病毒、蝙蝠冠状病毒RaTG13和新冠病毒之间观察到了推测的重组信号，特别是新冠病毒与广东穿山甲冠状病毒的受体结合域的氨基酸序列相似性高达97.4%。但蝙蝠冠状病毒RaTG与新冠病毒的受体结合域的氨基酸相似度仅为89.2％。

管轶等最新证据：走私穿山甲携冠状病毒，与新冠高度相似

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