数据仓储 系统 开源！

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强大的开源数据仓库系统

镜像源代码：

http://www.gitpp.com/plang/intermine

InterMine 是一个强大的开源数据仓库系统，专门为整合和分析复杂生物数据而设计。以下是 InterMine 的主要功能和特点：

1. 复杂的生物数据整合设施 ：InterMine 提供了一个基于序列本体论的核心生物模型，数据模型灵活且可扩展，可以通过编辑 XML 文件轻松添加新数据类型。提供多种数据解析器以促进数据加载，并在数据库构建后进行一系列一致性检查，确保数据正确整合。

2. 快速、灵活的查询 ：InterMine 的查询优化机制使得用户可以构建并执行多种查询，同时保持良好的查询速度。这种优化方法基于使用预计算表，这意味着数据模式不需要规范化以加快查询时间。系统足够快，可以处理大量数据。

3. 用户友好的网络界面和分析工具 ：InterMine 提供了一个新的界面，称为 BlueGenes，为探索和分析数据提供了更互动的体验。它包含了一些围绕列表分析（生物学中的常见需求）的功能，包括图形数据显示器和自动计算一组丰富统计数据的工具。它还包括报告页面、交互式结果表格、保存的模板查询、区域搜索工具和查询构建器。这使得在没有编程知识的情况下浏览和探索数据成为可能。用户可以在私人工作区中保存他们的数据和查询。

4. 广泛的 API 和网络工具集 ：InterMine 可以进行程序化访问，为五种常用编程语言（Python、Perl、Ruby、Java、JavaScript）提供了客户端库。这使得生物信息学家用户可以不使用网络应用程序就能访问 InterMine 功能，并使用单个脚本查询多个不同 InterMine 实例的数据，或作为自动化工作流程的一部分。它还使 InterMine 分析工具的轻松嵌入到外部网站以及访问 InterMine 数据的外部应用程序的开发成为可能。

5. 高度发展和可扩展的系统 ：InterMine 已经开发了超过 10 年，根据用户需求，我们引入了许多功能。这些功能包括面向过滤选项、启用布尔逻辑和集合操作、表格排序和过滤、一系列标准化的导出选项、Cytoscape 等其他工具的集成，以及作为外部网站的一部分嵌入单个分析工具。开源、可扩展的框架意味着 InterMine 也向其他开发者开放，以便在此基础上构建。

InterMine 的这些功能和特点使其成为生物信息学领域中一个强大而灵活的工具，特别适用于整合和分析复杂生物数据。

其应用场景主要包括：

1. 生物信息学研究 ：InterMine 支持从多种异构数据源创建大型生物数据库，并允许用户轻松集成新数据类型。这使得 InterMine 在生物信息学领域中非常有用，尤其是在整合和分析基因组、蛋白质组和其他生物数据方面。

2. 药物发现和疾病研究 ：InterMine 可以用于药物发现过程中的靶点识别和疾病机制研究，帮助研究人员理解不同生物数据之间的关系，并发现潜在的治疗靶点。

3. 个性化医疗