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国自然
作者:遥遥
(转载请注:解螺旋·医生科研助手)
如果是在做动物实验,而且是基因敲除鼠的实验,那么就会做大批量的小鼠基因型鉴定试验,来确定自己小鼠的基因型,然而,再做实验的过程中往往会出现一些意想不到的结果,我作为一只实验狗在这里为大家提一点点小建议。
1、组织提取DNA 剪下老鼠0.5-1.2cm尾巴或者耳朵或者称取20mg组织样本,将样本剪碎放在1.5ml的EP管中。
2、在每个EP管中加入275微升的裂解液(我们实验室使用的是promega的试剂盒)将加入裂解液的组织放在55摄氏度的水浴箱中过夜(16—18h)裂解完全的标志是组织完全溶解。
3、第二天振荡每一个EP管,混匀后再离心,转速13000rmp时间是3分钟,取上清分离毛发,将取的上清加到柱型管中(有滤网的小柱型管,柱型管套装在1.5的EP管中)。
4、在每个柱型管中加入250微升的Wizard SV lysis Buffer,此裂解液需要提前水浴30min,55摄氏度。
5、离心3min 转速13000rpm ,倒掉滤液。
6、在每个管中加入650微升wash solution 离心1min转速13000rpm,这一步骤重复四遍,每一次都弃去管底的废液。
7、4次洗完之后,什么都不加再离心一次,1min 转速13000rmp。
8、离心之后取出,放入到新的EP管中,每一个EP管中加入50微升Nuclease-free-water(无核酸酶水)需要提前水浴30min中55摄氏度。加的过程中要充分覆盖管底,静置2min,离心2min,保留EP 管中的液体,此步骤重复两次。(如果要搁置需要保存在-20冰箱中)。
自此DNA已经提取完成。
1、将获得的液体加入PCR混合液中,凝胶电泳,鉴定基因型。
PCR混合液的配制方法ddH2O 9.5微升,Taq12.5微升,上游引物0.5微升,下游引物0.5微升。
每一个EP管中的总量是24微升,提取的DNA 只加1微升。
2、PCR扩增:将样品放入PCR仪扩增。
3、制胶——1%的胶。
小胶:琼脂糖0.25g+25mlTEB1%
中胶:琼脂糖0.5g+50mlTEB1%
大胶:琼脂糖1g+100mlTEB1%
4、将琼脂糖加入TEB溶液后微波炉加热3min,冷却后加入核酸染料EBC,倒入制胶器制胶,30min后取出胶放入电泳槽中,黑线朝向正极。
5、加样,加Maker。
6、电泳。
7、显影。