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天选思路怎能不会！天津中医药大学宋丽丽教授团队代谢组+网络药理学+铁死亡发表1区SCI，学吧！

生信图书馆 · 公众号 · · 2024-09-24 19:00

正文

中药是宝贵的财富，是千年经验的传承，也是前人宝贵的经验。利用现代科学阐明中药的作用机制恰是中医人该做的事情。

馆长想过，其实大家可以类比现在的人工智能大模型，中药的发展就是模型发展推演的过程，我们现在只拿到了结果，却难以理解其机制，现代科学也有很大进步空间，目前缺乏更有效的工具来解析中药。但是大家正在努力，相信有一天中医和中药都不再神秘。

扯远了，回归正题。现在大家都觉得网络药理学照搬生信那一套觉得水，但其实是一个非常高效的工具，也为中药作用机制阐释提供了便捷。今天分享天津中医药大学宋丽丽教授团队这篇结合代谢组+网络药理学+铁死亡的文章，无论是参考做机制研究还是参考发文章都有借鉴价值！一起看下吧：

中西医结合的预防机制探索：研究从传统中药四妙丸（SMW）出发，探索其通过铁死亡这一现代生物学过程预防RA-ILD的潜在机制，实现了中西医结合的创新研究思路。

多组学方法的综合应用：研究结合了代谢组学、网络药理学和分子生物学等多种组学方法，不仅预测了SMW的潜在作用靶标，还通过代谢组学分析发现了与SMW早期预防RA-ILD相关的七个生物标志物，并通过后续实验进行了验证。

药物作用机制的深入解析：研究不仅停留在药物效果的观察，还深入探讨了SMW如何通过调节脂质代谢、动脉粥样硬化、TNF和IL-17等信号通路发挥作用，为理解SMW的分子作用机制提供了新的视角，并为未来RA-ILD的治疗提供了可能的新靶点。

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l 题目：利用代谢组学和网络药理学分析四脉丸调节铁死亡预防RA-ILD的机制

l 杂志：Phytomedicine

l 影响因子：IF=6.7

l 发表时间：2024年8月

研究背景

间质性肺病（ILD）是类风湿关节炎（RA）的常见并发症，对患有此病的人的发病率和死亡率有显著影响。在临床环境中，四妙丸（SMW），一种传统中药，常被用于RA的治疗，因为它被认为具有减少炎症、消除多余湿气和缓解关节痛的特性。

研究方法

用UPLC-Q-TOF/MS和网络药理学预测SMW预防RA-ILD的潜在靶标。此后，使用HE染色、代谢组学和RT-PCR来研究SMW在早期阶段预防RA-ILD的机制。

主要结果

1.生化指标及病理形态学结果

通过建立胶原蛋白诱导的RA模型，评估SMW对RA-ILD的治疗效果。

结论：SMW能显著减少RA-ILD大鼠足趾肿胀，降低血清和肺组织中的炎症标志物，减轻滑膜增生和炎性细胞浸润，对RA-ILD具有早期治疗作用。

图1与SMW早期预防和治疗RA-ILD相关的血清生化指标和病理切片

2.对小鼠血清中的代谢组学进行了多变量统计分析

通过PCA和OPLS-DA对NC、RA-ILD和SMW组大鼠血清样本进行代谢组学分析。

结论：SMW通过调节与甘油磷脂代谢相关的7种生物标志物，改变了RA-ILD大鼠血清中的代谢物，显示出早期预防RA-ILD的潜力。

图2在正常对照组(NC)、类风湿关节炎相关性间质性肺病(RA-ILD)组和四妙丸(SMW)组中进行多因素统计分析以及潜在生物标志物的发现和筛选

3.SMW成分的鉴定

利用基峰离子流图技术对SMW提取物进行成分鉴定。

结论：共鉴定出46种化合物，涉及多种类别，包括生物碱、有机酸等，为理解SMW的药理作用提供了化学基础。

图3通过网络药理学鉴定SMW的化学成分并预测相关靶标和途径

4.基于网络药理学的SMW效果和机制分析

利用网络药理学分析SMW的活性成分和RA-ILD相关基因，构建蛋白质相互作用网络。

结论：鉴定出SMW的潜在作用靶标和与RA-ILD相关的信号通路，确定了核心靶标，并揭示了SMW可能通过调节这些靶标和通路来发挥对RA-ILD的治疗效果。

5.基于铁死亡的代谢组学和网络药理学整合分析SMW在早期预防RA-ILD的机制

结合代谢组学和网络药理学分析，探讨了SMW通过铁死亡途径早期预防RA-ILD的机制。结论：SMW可能通过调节与脂质代谢和铁离子平衡相关的关键靶标和生物标志物，如PTGS2、MAPK1和LysoPC，来实现对RA-ILD的早期预防和治疗。

图4网络药理学和代谢组学结果的综合分析

文章小结

本研究旨在通过评估不同大鼠组的足趾体积、细胞因子水平和组织病理学观察来阐明四妙丸（SMW）对类风湿关节炎相关性间质性肺病（RAILD）的治疗效果。此外，利用代谢组学的发现来识别与SMW早期预防RAILD有效性相关的七个潜在生物标志物。进一步地，网络药理学被用来展示SMW可能通过调节脂质和动脉粥样硬化信号通路以及肿瘤坏死因子（TNF）和白介素-17（IL-17）信号通路来对RA-ILD施加治疗影响。最终，代谢组学和网络药理学分析的结合，连同其相应的验证，阐明了利用SMW预防早期RA-ILD的机制与铁死亡途径密切相关。这一发现为SMW作为一种开创性的药物治疗RA-ILD提供了基础支撑。该研究结果四张大图，但是逻辑非常自洽，还结合了铁死亡这个国自然热点，锦上添花了属于是。对这篇文章思路感兴趣想get同款思路，直接带着文章链接滴滴馆长吧，咱们可提供免费方案评估，付费方案设计和数据分析，另外还有超值服务器租赁活动等您打call！

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