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生信宝典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因组序列

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2017-07-24 07:00

正文

为了一件小事也不得不写程序时,你是否会觉得心里很烦?本栏目旨在分享生物信息分析中的一些小技巧,纯傻瓜式操作,助你事半功倍,心情倍儿爽。

想要提取拟南芥1号染色体,正义链6666-8888位置的序列?你只需要三步。

第一步,在NCBI上Nucleotide条目下搜索到拟南芥1号染色体,点开进入下一步。

第二步,在右边的Change region shown中,选择Selected region并输入66668888,点击Update View进入下一步。


第三步,点击左边的GenBank,把格式改成FASTA,大功告成。

想要提取反义链怎么办?只需再加一步,在右边的Customize view中,勾选Show reverse complement,点击Update View