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TCGA/GEO数据库挖掘分析及癌症预后模型构建靶标筛选【7月19,22-23日】

医药加学习班  · 公众号  ·  · 2023-06-21 13:32

正文

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TCGA&GEO 数据分析及癌症预后模型构建靶标筛选研讨会

2023 年7月19日、22-23日 腾讯网络会议

背景简介:

随着后基因组时代生信分析方法的不断完善和创新,临床与生信的关联越来越密切。我们可以通过高通量数据快速、准确、创新的筛选到自己课题方向相关的关键靶标以及机制。高通量数据来源广泛,总体分成两类:( 1 )采集样本进行测序(自有数据);( 2 )公共数据库中免费下载高通量数据。

公共数据库的数据样本量大,免费而且选择范围广。常见的数据库有 TCGA 数据库和 NCBI GEO 数据库,里面含有大量的不同研究方向的样本高通量数据。

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。 TCGA 数据库中包含了常见了 40 种癌症方向的高通量数据及临床信息。大家对 TCGA 数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过 GEO 数据库进行。

本次培训 不仅仅要大家了解多种不同的生信分析思路,学会 TCGA & GEO 数据库的基础操作,比如 数据筛选,下载,差异分析,功能通路分析,预后分析等等,还有复杂的预后模型构建筛选风险基因的实操内容。可以说是基础分析与高级分析并存。

培训班针对生信 0 基础的学员进行教学,包教包会。

讲师简介:宋伟博士

成果: 参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向: 有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历: 在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。

主办方: 上海遐锦生物科技有限公司

会议时间 2023年7月19日、22-23日(2天1晚)

第1天 晚上19:00-22:00(线上)

第2、3天 白天9:00-18:00

会议地点 :线上:腾讯网络会议室,

线下:中兴和泰酒店 上海市浦东新区科苑路866号

会务费用 3500 /

优惠政策:

1. 提前 确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名,每人优惠100元

3.四人组团报名,每人优惠200元,

4.六人组团报名缴费,可免1人参会费!

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。

注意事项:使用win7以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

另外需安装腾讯会议软件。

交费方式:

A:银行转账

账户名称:上海遐锦生物科技有限公司账户号:31050179400000001610

开 户 行:中国建设银行上海马陆支行

B:支付宝转账

收款人:[email protected]户  名:金永红

C:公务卡微信支付

报名方式:


报名请识别二维码添加小编微信

朱老师:18117064991

通过本次学习,您可以学会以下作图(包括但不限于)

示例图样本表达箱式图

示例图差异结果展示:火山图与热图

示例图关键基因的聚类热图







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