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TCGA&GEO
数据分析及癌症预后模型构建靶标筛选研讨会
2023
年7月19日、22-23日 腾讯网络会议
背景简介:
随着后基因组时代生信分析方法的不断完善和创新,临床与生信的关联越来越密切。我们可以通过高通量数据快速、准确、创新的筛选到自己课题方向相关的关键靶标以及机制。高通量数据来源广泛,总体分成两类:(
1
)采集样本进行测序(自有数据);(
2
)公共数据库中免费下载高通量数据。
公共数据库的数据样本量大,免费而且选择范围广。常见的数据库有
TCGA
数据库和
NCBI GEO
数据库,里面含有大量的不同研究方向的样本高通量数据。
癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。
TCGA
数据库中包含了常见了
40
种癌症方向的高通量数据及临床信息。大家对
TCGA
数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过
GEO
数据库进行。
本次培训
不仅仅要大家了解多种不同的生信分析思路,学会
TCGA & GEO
数据库的基础操作,比如
数据筛选,下载,差异分析,功能通路分析,预后分析等等,还有复杂的预后模型构建筛选风险基因的实操内容。可以说是基础分析与高级分析并存。
培训班针对生信
0
基础的学员进行教学,包教包会。
讲师简介:宋伟博士
成果:
参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:
有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:
在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。
主办方:
上海遐锦生物科技有限公司
会议时间
:
2023年7月19日、22-23日(2天1晚)
第1天 晚上19:00-22:00(线上)
第2、3天 白天9:00-18:00
会议地点
:线上:腾讯网络会议室,
线下:中兴和泰酒店 上海市浦东新区科苑路866号
会务费用
:
3500
元
/
人
优惠政策:
1.
提前
确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2.三人组团报名,每人优惠100元
3.四人组团报名,每人优惠200元,
4.六人组团报名缴费,可免1人参会费!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:使用win7以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。
另外需安装腾讯会议软件。
交费方式:
A:银行转账
账户名称:上海遐锦生物科技有限公司账户号:31050179400000001610
开 户 行:中国建设银行上海马陆支行
B:支付宝转账
收款人:[email protected]户 名:金永红
C:公务卡微信支付
报名方式:
报名请识别二维码添加小编微信
朱老师:18117064991
通过本次学习,您可以学会以下作图(包括但不限于)
示例图样本表达箱式图
示例图差异结果展示:火山图与热图
示例图关键基因的聚类热图