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Olex2 中基本操作系列之精修、权重、坏点

研之成理 · 公众号 · 科研 · 2019-11-25 07:00

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目录

1. 精修基本操作(Refine)

2. 权重(Weighting Scheme)

3. 识别与删除坏点(Bad Reflection)

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1. 精修基本操作(Refine)

执行程序与方法设置：如下图所示，在 Work 窗口下展开 Refine栏，在Program下拉菜单设置精修执行程序，对于一般结构选择ShelXL即可，方法选择Least Squares(最小二乘法)，其后的Cycles中设置精修轮数，Peaks设置显示的残余电子峰(即Q峰)数目：

执行精修：精修执行程序、方法、精修轮数和Q峰数目设置好之后

A：按下Refine按钮(下图红色方框)执行精修

B：快捷组合键“Ctrl+R”执行精修

C：使用指令进行精修

指令格式：refine C P (C代表精修轮数；P代表Q峰数目)

例如指令“refine 4 10”代表精修4轮，显示10个Q峰

具体操作可以观看以下视频：

注：视频中双语字幕为笔者添加，可能有不当之处，还请广大睿智的读者朋友不吝指教！非常感谢！

2. 权重(Weighting Scheme)

在Work窗口下展开Refine栏，在Weight一行后有一个方框和两个数字，点击该数字可以刷新权重，这个需要每次精修前进行点击，如果将该方框勾上(点击即可)则每次精修时程序会自动调整权重：

当然了，权重也可以自己进行手动调整：

A：点击GUI面板上的铅笔图标(如下图上红色方框所示)，在弹出Edit对话框中WGHT一行手动调整：

B：在命令输入区键入指令“edit ins”并回车，在弹出ins文件中WGHT一行手动调整：

上述两个方法手动调整后，保存精修即可。

具体操作可以观看以下视频：

注：视频中双语字幕为笔者添加，可能有不当之处，还请广大睿智的读者朋友不吝指教！非常感谢！

3. 识别与删除坏点(Bad Reflection)

在GUI面板中，点击R1后面的“%”图标，在弹出的Fobs vs Fcalc散点图中可以看到这些衍射点基本上在一条直线上，如果有某些点严重偏离这条直线，那么可以点击这些偏离严重的衍射点将其删除(omit)，Olex2会自动在ins中添加omit指令：

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