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西北大学生命科学学院本科生姚佳俊作为共同第一作者
,参与的华大生命科学研究院研究项目成果在国际知名期刊《Cell》在线发表,论文题为《Spatiotemporal modeling of molecular holograms》。
众所周知,本科生能够在国际顶级期刊上发表文章,尤其是生物学领域的顶刊《细胞》,是非常了不起的成就,这不仅体现了个人的学术能力和研究潜力,也反映了所在院校和研究团队的实力。
下面,走进姚佳俊的科研之路,看看他是如何做到在本科就拿下一篇Cell一作的!
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姚佳俊的成功并非偶然,离不开他自己的努力,也离不开西北大学提供的优越科研环境和丰富的资源支持。
学校鼓励学生参与科研项目,提供实验室设备和资金支持,同时注重培养学生的创新能力和实践能力。在这样的环境下,姚佳俊得以充分发挥自己的潜能,不断探索科学的边界。
姚佳俊于2018年入读西北大学生命科学学院,2021年通过遴选进入华大创新班的“3+1”联合培养项目,期间在深圳华大生命科学研究院进行学习和实践。
在此期间,他接受了华大研究院多位老师的指导,深入了解组学领域的前沿科研进展,并参与了国内外多项合作研究,获得了斯坦福大学Xiaojie Qiu教授和南方科技大学胡宇慧教授的悉心指导。
得益于华大研究院“以项目带人才、带科研、带产业”的创新教育理念,姚佳俊参与了多个单细胞转录组与空间转录组学项目,包括《Spatiotemporal modeling of molecular holograms》和《A single-cell 3D spatiotemporal multi-omics atlas from Drosophila embryogenesis to metamorphosis》等。
在科研过程中,姚佳俊展现了极高的专业素养和严谨的科研态度。他深知科研工作的艰辛与挑战,因此在实验设计和数据分析阶段投入了大量的时间和精力,确保每一步都准确无误。他的努力和执着最终使得研究取得了突破性的成果。
在此次成果中姚佳俊负责3D模型生成、形态测量与分析等工作,为胚胎发育研究提供了重要数据。
量化胚胎发生过程中的时空动态对于理解先天性疾病至关重要。此次发表的研究成果中,姚佳俊和研究团队开发了 Spateo (https://github.com/aristoteleo/spateo-release),这是一个 3D 时空建模框架,并将其应用于 E9.5 和 E11.5 的 3D 小鼠胚胎发生图谱,捕获了 800 万个细胞。
Spateo 支持可扩展、部分、非刚性对齐、多切片细化和网格校正,以创建整个胚胎的分子全息图。它引入了数字化方法,以揭示从亚细胞到整个器官的多层次生物学,识别沿新兴 3D 结构的正交轴的表达梯度,例如,中脑-后脑边界 (MHB) 等二级组织者。Spateo 进一步联合模拟细胞间和细胞内相互作用,以剖析 3D 结构中的信号传导景观,包括丘脑内限制带 (ZLI)。
最后,Spateo 引入了细胞迁移的“形态测量向量场”,并整合了空间差分几何学,以揭示不对称小鼠心脏器官发生等的分子程序,将宏观变化与分子动力学联系起来。因此,Spateo 能够在 3D 空间中随时间推移在分子水平上研究器官生态学。
该论文由华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院等机构合作研究,借鉴物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型,开创性开发了三维时空建模工具包Spateo,使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。
该工具包的发布标志着时空组学研究迎来革新性突破,可全面支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究,为实现高精度时空生命全景观研究迈出了极为关键的一步。
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解读国际期刊投稿对图片的标准清单:版式、分辨率、格式、色彩模式;
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掌握所投期刊的要求,如何利用高质量配图博得审稿人的认可,做到“投其所好”;
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学习科研论文配图的图像学知识:位图与矢量图的不同适用场合及优劣对比、原始图像获取的注意事项、各种图像格式的适用场合及优劣对比;
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结合实例,讲解论文配图常见设计误区及标准解决方案;
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科研论文配图的设计思路:构图、箭头、线条、文字、配色以及形象化的表现手法
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收集图像数据,处理数据差异、调节采图参数;
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了解SCI杂志对图像的尺寸要求、采图原则、后处理注意事项;
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照片类图像数据的色彩校正深入分析讲解:图像剪裁、颜色匹配、颜色通道合成、明暗对比优化、电镜伪彩上色、黑场白场中性灰场等图像的理论知识,详解多图像排版等;
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学习电镜图的伪彩上色处理,光照不均校正/物镜污渍去除,白平衡的规范化调节等图像调节;
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图片瑕疵修复及科研论文配图允许范围内的修改方式和操作;
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图层/蒙版/曲线、调色:曲线/色阶、图像裁剪、像素/尺寸修改、自动拼接、测量、TEM照片上色。
『学习软件:Photoshop』
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三维绘图软件在科研论文配图设计中的重要应用,根据当场次学员科研背景进行特定模型素材的制作学习、常用造型的设计制作思路、如球棍模型、石墨烯、纳米颗粒、血管肿瘤、细胞膜、核壳结构等高精度模型;
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通过基础科研模型熟悉工具栏和基本操作,掌握3D建模基本技巧、学习常用功能的快捷操作、快速创建准确分子模型,制作DNA、细胞等模型,快速创建规律排列的晶体模型,一次性创建大量相同模型,制作纳米粒子胶束等,制作多孔模型、工业元器件,绘制细胞表面的凹凸,学会制作材料表面的鼓包等;
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学习三维灯光及渲染,使用主流渲染器并搭配合理的场景灯光设置,通过渲染模型和修改材质让图像更加立体生动。
『学习软件:C4D/3ds Max』
Photoshop在科研绘图中的应用
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结合高档次杂志最新案例进行临摹学习,学会使用如图层/蒙版/曲线、色阶、图像裁剪、像素/尺寸修改、自动拼接等重点功能;
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学习高级抠像的常用技巧、钢笔工具抠图、魔棒抠图、快速选择工具抠图等并赠送人像美化技法和超值资源素材包下载),根据当场次学员科研背景,详细教授论文配图中常用图形绘制;
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利用Photoshop实现艺术化封面/配图的设计,顶级杂志的封面设计技巧和基本思路,如何独立完成一张封面的设计。
『学习软件:Photoshop』
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学习快速制作高质量科研论文插图,探究配图基本的设计思路与设计流程,了解示意图绘制、配色的原理,学会美化图表、论文大图排版、会议展报布局的方法。学员在老师的带领下练习由简单到复杂的案例,在课程结束后学员有能力自己制作Nature等顶刊级别的图表;
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AI常规操作及科技绘图常用工具,利用AI进行数据图的颜色,版式美化、绘制精美二维图像(如温度计、大脑、小鼠的绘制等)、使用AI进行流程图的排版整合,最后结合实例详细教授AI绘制科研配图的技巧和要点;
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掌握文章插图中基本图形的艺术化设计制作,深入剖析高级色彩搭配的要点,解析学习两色/三色搭配、主色/辅助色/点缀色、相近色/对比色等多种配色原理和论文配色思路,并附赠超值资源包下载。
『学习软件:AI』
TOC/Scheme/Cover设计制作
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了解TOC内容图/Scheme流程图的基本要求,箭头标注的设置制作和使用标准,并且深入分析并详细解释如何思考布局、设置画布大小、字体与字号的选择、线条粗细、如何科学裁剪图片、如何精准排版、各种标注线和箭头的规范化处理、矢量绘图原理、常见效果及其实现、配色/字体/排版、论文配图要点及如何导出小体积高清图片;学习图像高端箭头,放大线绘制,由浅入深,逐层递进;
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结合国际顶级SCI期刊杂志封面及配图进行实战训练,从设计思路的整理、模型的设计制作和图片内容的排版制作等角度进行深度解析,手把手带领学员从零开始学习设计制作。学会运用Ps、AI、C4D/3ds Max等专业绘图软件的各种优势功能,美化加工制作技术路线图,反应机制图,基本几何图形如矩形/圆形/线条/多边形/箭头等,并使用填充,渐变,阴影等效果提升几何图形的质感,增加立体效果,绘制高级箭头;
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随课赠送原版科研绘图素材包以供学员课后投稿使用,掌握绘制常用图像处理/示意图,轻松应付日常应用场景,并具备以后自我提升的方法能力。
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熟练使用国际通用的论文配图制作软件Photoshop、Illustrator、C4D/3ds Max及其他图表制作软件;
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配合制作出符合国际规范的、可投稿至世界任何国际期刊的高质量论文配图;
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了解并掌握所投期刊的不同要求,利用高质量配图博得审稿人的认可,做到“投其所好”;
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掌握科研论文配图的设计思路:从构图、箭头、线条、文字、配色以及形象化的表现手法等多个角度综合总体提升图片质量;
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毕业答辩、成果汇报、项目申请书撰写、著作编纂等工作中,需要高质量图片均可轻松应对。
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(由山东子公司收款)
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自2015年起,中科幻彩先后在清华大学、北京大学、中科院理化所、过程所、大连化物所、吉林大学、厦门大学、四川大学、华中科技大学、暨南大学、齐鲁工业大学、北京印刷学院等数十家单位开展专场培训,为相关单位的科研人员提供定制化的绘图技能培训服务,在提升科研绘图水平的同时,也丰富了学生课余生活,增加专业技能,帮助学生们从零基础入门到轻松玩转C4D/3ds Max/Ps/Ai等常用绘图软件,帮助科研工作者掌握绘制论文配图的技巧,注重实用性和技巧性。
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为保证教学质量,也为学员营造舒适的学习环境,我们每场培训都会将招生人数限制在20人以内,以保证良好的课堂秩序,同时安排助教协助学员进行软件安装、现场答疑、课堂辅助教学等。
我是慢热型的学生,接受新知识慢,一次学不够怎么办?
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想象一下
如果以后刷文献就像刷短视频一样
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顶级学术大佬最新成果
想必看文献也将变成一件有趣的工作
因为科学成果的表达有更高效更直接的载体
——科学动画
继封面之后
科学动画正逐渐成为学术圈大佬们的新宠
因为它的用途实在是太广泛
附加值可谓相当高
北京理工大学低碳技术管理团队自主设计开发了碳排放 “测-算-控-谋”技术体系,科学量化了各项技术的减排贡献,实现北京冬奥碳减排行动评估有据可依、有数可查、有物为证。中科幻彩为其制作了相关科学原理动画视频,
2022北京冬奥会期间在水立方、国家速滑馆等奥运场馆滚动播放,并在央视新闻频道播出。
中科幻彩制作,
央视新闻频道播出
冬奥期间在水立方等奥运场馆滚动播放
中国科学院院士
、中科院物理研究所研究员
高鸿钧团队
在世界上首次实现了原子级精准控制的石墨烯折叠,其成果发表在了国际顶级杂志
Science
上。
科学技术部高技术研究发展中心发布了“
2019年度中国科学十大进展
”。中国科学院物理研究所柳延辉研究组
「基于材料基因工程研制出高温块体金属玻璃」
的科研成果由中科幻彩为其制作了相关科学原理动画以及展示效果图,
并
在
新闻联播
播出
。
中国科学院国家空间科学中心对
中国科学院空间科学战略性先导科技专项
中部署的3颗卫星
最新重大科学成果
进行了集中发布。中科幻彩有幸为其成果设计制作了演示视频动画,该动画在
央视新闻频道播出
。
复旦大学高分子科学系、聚合物分子工程国家重点实验室教授聂志鸿团队在纳米
“人造分子”制备领域
取得重大突破,发表于国际顶尖学术期刊
Science
杂志。中科幻彩有幸为其成果设计制作了原理视频动画和艺术呈现图。
Nature
杂志在线发表了普林斯顿大学和北京大学团队在在量子拓扑物质研究领域的最新进展,中科幻彩有幸为其成果设计制作了原理视频动画和艺术呈现图。
暨南大学李丹教授团队报道了一种具有嵌入分子口袋的MOF材料,在基本不同的压力下向丙烯和丙烷开放,提出了
下一代筛分材料设计
,在吸附分离中有巨大的潜在应用。相关研究工作发表在国际顶级期刊
Nature
上,中科幻彩为其成果设计制作了科学原理演示视频动画。
中国科学院动物研究所研究人员在
Cell
杂志
发表论文
,首次发现了年轻的 ERV 亚家族在细胞衰老过程中被再度唤醒,提出了古病毒复活介导衰老程序化及传染性的理论,并且创新性地发展出阻断 ERV 古病毒复活及扩散以实现延缓衰老的多维干预策略,
中科幻彩有幸为其成果设计制作了
科学原理演示视频动画,并在央视一套播出。
中科院苏州纳米所副研究员朱玉长与苏州大学教授靳健、美国范德堡大学教授林士弘合作,提出了一种
原位构筑二维分形枝晶结构
,并以此为模板提升聚酰胺分离层有效过滤面积,进而大幅度提升纳滤膜分离通量的新策略。
相关研究工作发表在国际顶级期刊
PNAS
上,
中科幻彩为其成果设计制作了
科学原理演示视频动画。
国际著名期刊
Nature Astronomy
在线发表了慧眼(HXMT)卫星最新观测结果:在高于200千电子伏特(keV)的能段发现了
黑洞双星系统的低频准周期振荡
,中科幻彩为其成果设计制作了演示视频动画、艺术呈现图以及文章插图,该动画在
央视新闻频道
播出
。
中国科学院院士刘云圻
利用化学气相沉积法合成氮掺杂石墨烯并对其电学性质进行了研究,发现氮掺杂可以有效地影响石墨烯的电学性质,极大地推动了石墨烯的研究与应用。