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细胞因子检测方法概览

闲谈Immunology  · 公众号  ·  · 2024-08-21 08:16

主要观点总结

本文主要介绍了细胞因子检测的多种方法和技术,包括免疫检测和其他现代技术。这些方法和技术包括酶联免疫吸附法(ELISA)、蛋白质印迹、电化学发光免疫分析、基于磁珠的抗体芯片、抗体芯片、质谱、单分子技术如单分子计数(SMC)、单分子阵列等。

关键观点总结

关键观点1: 酶联免疫吸附法(ELISA)是细胞因子检测的基础和关键定量技术。

ELISA是免疫检测中的一种常见方法,具有较高的灵敏度和特异性。

关键观点2: 蛋白质印迹法适用于复杂生物样品和组织中的细胞因子分析。

蛋白质印迹法通过抗体和分子量信息提升特异性,化学发光技术的飞速发展显著提升了其检测灵敏度。

关键观点3: 电化学发光免疫分析和基于磁珠的抗体芯片是临床研究中常用的细胞因子检测方法。

这些方法具有高灵敏度、宽动态定量范围和高通量等特点。

关键观点4: 现代技术如抗体芯片、质谱和单细胞技术在细胞因子检测中显示出潜力。

这些技术提供更高的灵敏度和特异性,为细胞因子研究提供了新的视角。


正文

细胞因子检测/定量主要依赖于免疫检测。免疫检测利用抗体的高灵敏度和特异性来检测目标蛋白,常见的免疫测定大多可达到 1–100 pg/mL 蛋白质浓度的灵敏度。
1.酶联免疫吸附法

酶联免疫吸附实验(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)于1971年被开发 [ Engvall, E.; Jonsson, K.; Perlmann, P. Enzyme-linked immunosorbent assay. II. Quantitative assay of protein antigen, immunoglobulin G, by means of enzyme-labelled antigen and antibody-coated tubes.Biochim. Biophys. Acta 1971, 251, 427–434; Van Weemen, B.K.; Schuurs, A.H.W.M. Immunoassay using antigen-enzyme conjugates. FEBS Lett. 1971, 15,232–236] ,是基础研究和临床检测中单一指标定量的关键技术。
商业化ELISA最常用的是三明治夹心法ELISA,特异性好。此外,还有直接法ELISA、间接法ELISA、竞争法ELISA等应用于不同场景。

几种常见ELISA比较(Journal of Natural Medicines (2018) 72:32–42)
2.蛋白质印迹

尽管蛋白质印迹法在40年前就已经被开发出来 [Towbin, H.; Staehelin, T.; Gordon, J. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: Procedure and some applications. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1979, 76, 4350–4354.] ,通过抗体和 分子量信息(和ELISA比较) 提升特异性 化学发光技术的飞速发展,显著提升了检测灵敏度,因而它依然是蛋白质检测相对定量的关键而强大的技术。
与适用于溶液中细胞因子检测的ELISA不同,蛋白质印迹法更适合分析 复杂生物样品 组织中 的细胞因子。
虽然蛋白质印迹可能不如ELISA敏感,但其提供 蛋白质分子量信息是不可替代 ,尤其对有剪切体的细胞因子,也可区分无活性前体和活性形式。
例如,IL-1β是一种促炎多效性细胞因子,前体为31 kDa,由Caspase-1加工成成熟,其 活性形式 为17 kDa。尤其在实体瘤等研究中,蛋白质印记的重要性凸显。
蛋白质印迹也可使用磷酸化位点特异性抗体 研究细胞因子(受体)磷酸化 。例如,葡萄膜黑色素瘤细胞系中的VEGF受体磷酸化,以监测VEGF-A及其抑制剂(贝伐珠单抗)对细胞增殖、迁移、侵袭和其他细胞因子产生的影响。

蛋白质印记可以区分细胞因子细胞核和细胞质定位。大多数细胞因子在分泌前位于产生细胞的细胞质中。然而,某些细胞因子(例如IL-1家族成员IL-1α,IL-33和IL-37)已检测到核定位。IL-1α的核定位主要见于静息细胞,其中IL-1α可能作为调节细胞生长和分化的转录因子。

3.电化学发光免疫分析

电化学发光(ECL)是一种将电能转化为光发射的电化学反应。第一个ECL免疫测定法是在上世纪九十年代开发的 [Obenauer-Kutner, L.J.; Jacobs, S.J.; Kolz, K.; Tobias, L.M.; Bordens, R.W. A highly sensitive electrochemiluminescence immunoassay for interferon alfa-2b in human serum. J. Immunol. Methods 1997, 206, 25–33.] ,利用钌配合物进行电化学发光反应。
目前,ECL广泛用于临床,临床前和基础研究。ECL免疫测定平台主要包括Meso Scale Diagnostics(MSD)公司QuickPlex SQ120等,结合其平板抗体芯片,检测线性范围可以达到4-6个数量级,灵敏度可达亚皮克级。

MSD官网

4.基于磁珠的抗体芯片
基于微球的多重检测是最常用的多重细胞因子检测形式,具有高精度、灵敏度、重现性、宽动态定量范围、高通量以及使用低至 25 至 50 μL 样品定量多种分析物的能力。
这种液体芯片主要基于夹心ELISA的原理。经典的测试仪器包括流式细胞仪和Luminex。
在典型的Luminex设置中,红色激光(分类激光)激发磁珠内部染料以识别每个微球颗粒(分析物)。同时,从藻红蛋白的荧光强度量化细胞因子量,藻红蛋白已被绿色激光(检测激光)激发。
使用Luminex测定,理论上可以同时测量多达100种,甚至几百种分析指标。然而,为了避免抗体的交叉反应等,一个组合一般可以测试30种分析指标。
基于磁珠的液体芯片检测范围可达 3–4 个数量级,灵敏度达到1-10皮克/mL 。使用精密反向移液和优化的标准品稀释,某些细胞因子的检测下限可能扩大到1 pg/mL以下。


5.抗体芯片

抗体芯片是一种可靠而稳健的方法,用于从复杂蛋白质组中提取多重数据,具有高灵敏度、高特异性和高通量。
第一个抗体芯片是由Chang于1983年开发的,在1cm2面积的玻璃盖玻片上发现了10×10和20×20网格中的抗体 [Chang, T.W. Binding of cells to matrixes of distinct antibodies coated on solid surface. J. Immunol. Methods 1983, 65, 217–223]。
当前抗体芯片多用三明治夹心或直接标记,使用化学发光或者荧光进行检测。

三明治夹心抗体芯片使用抗体对,必须验证和检查与阵列中所有其他抗原/抗体的交叉反应性。出于这个原因,芯片一般涵盖10到80个分析指标。通过组合多个阵列,可以检测和定量人体样品中多达1000种分泌的人类蛋白质,如细胞因子、趋化因子、脂肪因子、生长因子、蛋白酶、可溶性受体和其他蛋白质。此外,小鼠、大鼠、牛、羊等不同种属的芯片,也有开发。
6.质谱

质谱(MS)是蛋白质组学中的一项基本技术,适用于蛋白质鉴定和定量。在经典的蛋白质组学工作流程中,蛋白质被分离(可以添加富集或预分级步骤)并通过特定蛋白酶(例如胰蛋白酶)消化为较小的肽。然后对肽进行浓缩和脱盐,通过高效液相色谱(HPLC)分离,电离并通过MS进行分析。串联质谱仪(MS / MS)测量MS实验中肽(母离子)及其碎片离子的精确质荷(m / z)比。

Metzemaekers M, et al, (2021) From ELISA to Immunosorbent Tandem Mass Spectrometry Proteoform Analysis: The Example of CXCL8/Interleukin-8. Front. Immunol. 12:644725. doi: 10.3389/fimmu.2021.644725

这种方法可以对肽/蛋白质进行非常特异性的鉴定和定量。尽管MS是一种强大的蛋白质组学技术,但在细胞因子分析中的应用具有挑战性。应考虑MS的几个局限性:(1)MS只能检测带电(电离)肽,但并非所有肽都以相同的效率电离。此外,低分子量的蛋白质(包括大多数细胞因子)提供的肽较少,并且与丰度低,如果不进行富集或预分馏,这些肽将无法检测到。(2) 鸟枪法MS的灵敏度通常不足以检测复杂生物样品(血清或血浆)中的低丰度蛋白质(如细胞因子)。例如,人血浆中血清白蛋白和IL-6的浓度相差10个数量级。(3)基于MS的方法具有高度重现性,但质量控制(例如,内标蛋白质/肽)对于控制蛋白质消化功效、HPLC肽分离和MS性能至关重要。鸟枪法蛋白质组学(数据依赖性采集(DDA),见下文)是部分随机的,因为根据离子信号强度通过计算机控制的算法选择母离子进行碎裂,因此重复分析同一复杂样品可能会产生略有不同的鉴定蛋白质列表,特别是在蛋白质丰度低的情况下。另一方面,靶向方法((selected reaction monitoring,SRM或 multiple reaction monitoring/MRM))不会遇到此问题,并提供可靠且可重现的分析。(4)蛋白质鉴定依赖于蛋白质数据库,并且可能对非人类生物体(例如,生物医学研究中使用的动物模型)的覆盖率不足。
MS方法提供了相对容易的多重检测能力和更高的特异性,但灵敏度低于免疫检测。
7. 单分子技术
单分子计数(. Single Molecule Counting,SMC)技术最初由Singulex公司开发,将基于磁珠的免疫测定与单分子计数检测相结合 [Wu, A.H.B.; Fukushima, N.; Puskas, R.; Todd, J.; Goix, P. Development and preliminary clinical validation of a high sensitivity assay for cardiac troponin using a capillary flow (single molecule) fluorescence detector. Clin. Chem. 2006, 52, 2157–2159.]。
经典的 96 孔板中,基于磁珠的免疫测定法用于形成夹心复合物(捕获抗体-抗原-荧光标记的检测抗体包被的磁珠)。然后,破坏夹心复合物,并使用专有的数字SMC技术分析洗脱的荧光标记检测抗体,使用激光共聚焦显微镜数字计数器对单分子荧光信号(“闪光”)进行计数。
SMC 检测试剂盒可检测人体样品中的细胞因子,灵敏度为 sub-pg/mL

8.单分子阵列

单分子阵列(Simoa)由Quanterix Corp.开发,是一种数字ELISA,灵敏度可达亚fg/mL浓度。
Simoa基于经典的夹心免疫测定磁珠,然后进行数字检测。抗原被固定在磁性微珠上的抗体捕获,并通过添加生物素化检测抗体和链霉亲和素标记的酶,形成免疫复合物。然后将磁珠加载到由50,000个孔(46fL孔,每个孔只能容纳一个磁珠)组成的微孔阵列中,并在荧光底物存在下密封。由于反应体积极小,即使孔中仅存在一种酶分子,荧光产物的浓度也很容易达到可检测范围。
目前可以同时测量多达10种分析指标,灵敏度0.01–0.03 pg/mL。

9.免疫PCR反应

免疫PCR最初描述于1992年 [ Sano, T.; Smith, C.L.; Cantor, C.R. Immuno-PCR: Very sensitive antigen detection by means of specific antibody-DNA conjugates. Science 1992, 258, 120–122] ,结合免疫测定的高特异性和聚合酶链反应(PCR)的高灵敏度。
与传统ELISA中底物和产物之间的线性关系相比,聚合酶可实现信号指数级放大,灵敏度 比普通ELISA高1000倍
夹心形式的免疫PCR,与夹心ELISA相同,在捕获抗体包被的96孔板中进行。与 ELISA 测定中用于检测的酶抗体偶联物不同,免疫 PCR 利用与 DNA 共价偶联并通过定量 PCR 检测的检测抗体。

Niemeyer, C.M.; Adler, M.; Wacker, R. Detecting antigens by quantitative immuno-PCR. Nat. Protoc. 2007, 2, 1918–1930

虽然免疫PCR的优点是显而易见的(例如,超灵敏、良好的重现性和普遍性),但其主要局限性是背景高且需要大量的洗涤步骤。

10. 者邻近连接技术

邻近连接测定(proximity ligation assay,PLA)最初由Fredriksson等人开发 [Fredriksson, S.; Gullberg, M.; Jarvius, J.; Olsson, C.; Pietras, K.; Gústafsdóttir, S.M.; Ostman, A.; Landegren, U. Protein detection using proximity-dependent DNA ligation assays. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 473–477.] ,他们使用对血小板衍生生长因子(PDGF)具有亲和力的DNA适配体来量化PGDF。同源二聚体PDGF-BB可以容纳两个适配体分子,每个分子都具有引物结合的延伸和额外的延伸,在杂交到共同的连接器寡核苷酸时进行连接。PCR产物的实时检测可检测到低至10−20摩尔蛋白浓度。

11.邻近延伸检测

邻近延伸测定(Proximity Extension Assay,PEA)是PLA的替代方法。两种技术的主要区别在于,PLA的连接事件被PEA中的DNA聚合步骤所取代,从而最大限度地减少了背景噪声并提高了测定灵敏度 [Greenwood, C.; Ruff, D.; Kirvell, S.; Johnson, G.; Dhillon, H.S.; Bustin, S.A. Proximity assays for sensitive quantification of proteins. Biomol. Detect. Quantif. 2015, 4, 10–16]
目前Olink对该技术进行了商业化, 可在 1 μL 样品同时分析数十种生物标志物。
12.免疫磁减量检测
2006年首次描述了 磁减量 生物分析技术 [Hong, C.-Y.; Wu, C.C.; Chiu, Y.C.; Yang, S.Y.; Horng, H.E.; Yang, H.C. Magnetic susceptibility reduction method for magnetically labeled immunoassay. Appl. Phys. Lett. 2006, 88, 212512] 。目前的免疫磁减量(IMR)测定, 将捕获抗体 固定在磁性纳米颗粒。这种纳米颗粒均匀分散在溶液中,并通过施加外部多个磁场(即易受磁场影响)而振荡。加入分析样品后,由于抗体捕获分析物分子,纳米颗粒变得更重,导致纳米粒子对磁场的响应降低,降低程度对应于样品中存在的目标分子的量,能够检测pg/mL浓度的蛋白质






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