晚清以来，美国人热衷在中国建立大学，由于美国人基本信仰基督教，所以美国在华所办的教会大学都是基督教大学。
结果1912年民国成立时，基督教大学在中国已经建有十多所了，而在中国的天主教大学仅有一所震旦大学，1921年才出了第二所天津农工商大学。显然，这与天主教在世界信众中的地位是极不相称的。1919年，罗马教廷派代表来中国考察天主教会的教育情况，代表在报告书中表达了中国高等天主教教育机构不足的担忧。1920年，美国天主教本笃会神父奥图尔（George Barry O’Toole O.S.B）来中国与创办《大公报》的英敛之商谈在北京兴办天主教大学事宜，达成共识后，奥图尔前往罗马教廷请求襄助。1922年，新任教皇庇护十一世（Pope Pius XI ）非常赞成在中国的首都创办天主教大学，在1923年个人捐款10万里拉委托美国本笃会在中国创办大学。
《大公报》的英敛之
1925年3月，美国本笃会以16万元购得北京西城区清室皇族载涛的贝勒府，占地60余亩，有房屋400余间，作为兴办大学的校址，沿袭英敛之曾开办的辅仁社作为学校名称，由英敛之担任社长。学校请来史学家陈垣、李泰棻、地理学家张蔚西、前清进士郭家声等人任教，招收学生23人为升入大学的预备。遗憾的是，第一任社长英敛之于1926年1月10日病逝，校务由陈垣负责。陈垣积极扩充教学设备，按照教育部规章组织董事会。1927年，董事会聘奥图尔担任校长，陈垣担任副校长，学校正式定名辅仁大学。1929年，学校向国民政府教育部呈请立案，以陈垣为校长。
辅仁大学主校政者：校长陈垣（前左四）、校务长兼哩学院院长奥图尔神父（前中）、秘书长英千里（前右三）、文学院院长沈兼士（前右四）、教育学院院长张怀（前左三） ...
辅仁大学一成立就是高起点。1929年11月辅仁举行新校舍兴建典礼，全部工程耗资60余万元，建立起包括大学部、高中部、初中部为一体的总结构。不止西语系，物理系、化学系、心理系、哲学系等课程也都采用美国和德国原版教材，国文教育则选用文言文教材，教育学院还要求学生在每个学年结束必须上交升级论文。
要进辅仁大学读书很难，因为录取率从1930年开始逐年下降，1932年仅23%。教务长刘半农（就是发明“她”的那个人）表示：“我们不愿招生太多的缘故，并不是因为怕赔钱；我们办学之前，就预备赔钱的；怕的是招生太多，就不免滥收。”（刘半农《辅仁大学的现在和未来》）
辅仁剪影
入读难，毕业更难！在辅仁大学，60分是不能万岁的，因为学生除了要拿到政府教育部要求的134学分外，还要拿到学校要求的201成绩分才能毕业；学生每个学年的成绩分与学分比例至少要达到3：2才能升级，平均成绩D等（60-64分）的学生没有资格参加选修课，而没有学完选修课的学生又不能毕业。（叶世蓉《辅大男部生活杂写》，1939年《辅仁大学年刊》）至1936年，辅仁大学6届总招生数是879人，总毕业数仅401人。
1933年，大萧条使得美国本笃会无法继续资助辅仁大学，罗马教廷交由德国圣言会接管。1937年七七事变，北平沦陷。陈垣坚持辅仁大学留在北平，他说：“余如南归，辅仁大学数千青年，有何人能代余教育之？沦陷区正气有何人能代余支持倡导，且余之图书，又不能全部带去，只身南逃，尤属不宜。”
由于德国与日本的同盟关系，辅仁大学成为北方沦陷区唯一一所不挂日本国旗、不用日本教材的学校，学校每逢集会，都只升校旗。启功回忆，陈垣曾对他说：
“一个民族的消亡，从民族文化开始。没听说，民族文化不消亡，民族可以消亡的。我们要做的是，在这个关键时刻，保住我们中华民族的文化，把这个继承下去。你我要坚守教书阵地，只管好好备课，教书，这也是抗战！” （刘宜庆《浪淘尽》）
由于辅仁大学是沦陷区唯一不受日本控制的大学，所以沦陷区青年莫不以考入辅仁大学为荣。抗战结束后，北平媒体赞誉辅仁大学为故都的“抗日大本营”。
民国36年-私立辅仁大学附属中学毕业证书附存根-照片
1950年10月，中华人民共和国政府宣布接管辅仁大学，辅仁大学成为新政府正式接管的第一所教会大学。1952年，新政府对全国高等院校、院系调整，辅仁大学被并入北京师范大学，陈垣，成了北师大的校长。1959年，时任教皇约翰二十三世联络中国主教团、圣言会及耶稣会合作筹备在台湾恢复辅仁大学，任命于斌为大学校长，并亲自捐资10万美元。
1960年，辅仁大学在台湾复校。
辅仁大学学校财团法人辅仁大学（Fu Jen Catholic University, FJU），也称为天主教辅仁大学，简称辅大，是位于台湾省新北市新庄区的一所著名私立大学，普遍被视为台湾最顶尖的私立综合大学。根据2015年中国两岸四地大学排行榜，辅仁大学名列5星级“中国高水平大学”，是台湾岛内获此殊荣的两所私立大学之一。
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